More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4756 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 141 aa  279  8.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  92.42 
 
 		 141 aa  244  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  73.76 
 
 		 148 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  72.66 
 
 		 151 aa  197  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  72.66 
 
 		 151 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  71.94 
 
 		 191 aa  194  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  62.41 
 
 		 176 aa  177  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  67.15 
 
 		 155 aa  176  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  60.71 
 
 		 176 aa  176  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  60.71 
 
 		 157 aa  176  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 146 aa  175  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  63.77 
 
 		 145 aa  173  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  62.07 
 
 		 151 aa  173  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  64.75 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  62.94 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  62.94 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  62.32 
 
 		 145 aa  171  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  62.24 
 
 		 148 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  57.97 
 
 		 152 aa  170  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  60.42 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  61.59 
 
 		 149 aa  167  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  61.64 
 
 		 154 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.43 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  62.12 
 
 		 145 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  60.96 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  59.85 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  61.59 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.04 
 
 		 165 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 153 aa  160  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  58.82 
 
 		 148 aa  159  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  58.09 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  57.93 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.68 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 147 aa  157  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  56.2 
 
 		 150 aa  156  9e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  56.52 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.14 
 
 		 150 aa  155  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  58.65 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 150 aa  155  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 156 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  59.71 
 
 		 149 aa  153  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  56.52 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  57.24 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.25 
 
 		 152 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.16 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 148 aa  150  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.55 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  56.52 
 
 		 153 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  56.52 
 
 		 153 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 145 aa  150  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 147 aa  150  7e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 149 aa  149  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 159 aa  149  8.999999999999999e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 146 aa  149  8.999999999999999e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  62.14 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  55.88 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  55.22 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  58.82 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1476  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 178 aa  148  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.97 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.42 
 
 		 184 aa  148  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 144 aa  147  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.28 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  54.89 
 
 		 152 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  58.82 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 145 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 145 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 		 153 aa  146  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0768  3-dehydroquinate dehydratase  56.55 
 
 		 167 aa  147  7e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000317323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.92 
 
 		 138 aa  146  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  55.88 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4700  3-dehydroquinate dehydratase  62.7 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0672419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  56.72 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  56.72 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  58.52 
 
 		 151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  56.72 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.01 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  56.72 
 
 		 193 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  56.72 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.68 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.86 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>