More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4748 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4748  peptide chain release factor 1  100 
 
 
359 aa  713    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0112  peptide chain release factor 1  98.05 
 
 
359 aa  704    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  84.17 
 
 
361 aa  610  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0894  peptide chain release factor 1  82.5 
 
 
361 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0918  peptide chain release factor 1  82.78 
 
 
361 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0955  peptide chain release factor 1  82.78 
 
 
361 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal  0.0330786 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  69.12 
 
 
360 aa  495  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0889  peptide chain release factor 1  69.49 
 
 
358 aa  486  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491137  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0470  peptide chain release factor 1  65.1 
 
 
361 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  64.61 
 
 
358 aa  478  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  66.67 
 
 
360 aa  472  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  63.23 
 
 
361 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  63.23 
 
 
361 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  64.07 
 
 
361 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7604  peptide chain release factor 1  64 
 
 
361 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  63.79 
 
 
377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  63.79 
 
 
359 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  63.51 
 
 
357 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  61.56 
 
 
359 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0512  peptide chain release factor 1  61.94 
 
 
361 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  61.84 
 
 
359 aa  435  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  61.56 
 
 
360 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  61.56 
 
 
359 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  61.56 
 
 
359 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  62.12 
 
 
355 aa  426  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  58.43 
 
 
359 aa  424  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  60.45 
 
 
350 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  59.55 
 
 
360 aa  418  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  61.54 
 
 
354 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  62.11 
 
 
354 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  61.54 
 
 
351 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  59.6 
 
 
355 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  55.68 
 
 
356 aa  408  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  62.11 
 
 
351 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  59.38 
 
 
363 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  61.82 
 
 
351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  62.68 
 
 
351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 
361 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  60.45 
 
 
360 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  57.26 
 
 
360 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  58.4 
 
 
361 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  59.89 
 
 
351 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 
362 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 
360 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 
360 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 
361 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  57.63 
 
 
360 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  55.65 
 
 
360 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 
360 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  57.79 
 
 
363 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
360 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  56.7 
 
 
361 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5314  peptide chain release factor 1  58.64 
 
 
360 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  57.26 
 
 
361 aa  396  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  56.29 
 
 
363 aa  395  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  55.65 
 
 
360 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  55.37 
 
 
360 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0980  peptide chain release factor 1  59.94 
 
 
334 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 
361 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 
361 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  57.35 
 
 
360 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 
363 aa  392  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1044  peptide chain release factor 1  58.5 
 
 
364 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 
356 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  54.99 
 
 
361 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  56.86 
 
 
360 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0340  peptide chain release factor 1  58.26 
 
 
361 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 
363 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3552  peptide chain release factor 1  55.43 
 
 
362 aa  391  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0245342  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0137  peptide chain release factor 1  59.66 
 
 
352 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.490525  normal  0.171192 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  56.41 
 
 
363 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 
363 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0920  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 
361 aa  388  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000562935  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  56.7 
 
 
361 aa  388  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  57.26 
 
 
361 aa  388  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  55.84 
 
 
363 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  55.84 
 
 
363 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  55.84 
 
 
363 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  55.65 
 
 
360 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 
363 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  54.62 
 
 
361 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  55.84 
 
 
363 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 
360 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 
363 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 
360 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  55.31 
 
 
362 aa  384  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 
360 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  55.65 
 
 
360 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  57.19 
 
 
359 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  56.78 
 
 
354 aa  388  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 
360 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 
360 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  56.63 
 
 
359 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0646  peptide chain release factor 1  56.98 
 
 
357 aa  386  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 
360 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 
360 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 
360 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 
362 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  55.14 
 
 
360 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 
360 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>