72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4743 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4743  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 457 aa  874    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0107  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  71.81 
 
 		 453 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0184  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  62.14 
 
 		 453 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.864216  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0239  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  61.67 
 
 		 453 aa  490  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5654  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  61.05 
 
 		 471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2036  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  51.17 
 
 		 463 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4219  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  52.56 
 
 		 465 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.340628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2577  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  47.2 
 
 		 469 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.301233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2302  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  47.2 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.172272  hitchhiker  0.00762339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0519  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  51.77 
 
 		 463 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2259  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  46.53 
 
 		 469 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.466386  normal  0.36502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3542  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  45.37 
 
 		 472 aa  347  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.919124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0342  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  35.6 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450847  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3025  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  32.08 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2265  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  34.76 
 
 		 442 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00194673 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2525  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.13 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.839724  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0899  hypothetical protein  24.88 
 
 		 437 aa  149  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727607  normal  0.541745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3430  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.55 
 
 		 461 aa  146  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0409  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.06 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.309942  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2087  hypothetical protein  30.62 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073016  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1959  hypothetical protein  26.82 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2797  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  28.15 
 
 		 485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3495  hypothetical protein  27 
 
 		 465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2929  hypothetical protein  28.86 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0484025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2753  hypothetical protein  28.03 
 
 		 433 aa  133  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0100  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.35 
 
 		 480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0702  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.09 
 
 		 480 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.871087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0249  hypothetical protein  24.32 
 
 		 448 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1545  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  28.35 
 
 		 468 aa  126  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0909  hypothetical protein  25.63 
 
 		 491 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5694  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.83 
 
 		 477 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2760  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.26 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1581  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.68 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6537  hypothetical protein  25.06 
 
 		 467 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.866176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4597  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.18 
 
 		 454 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.244351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4331  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.71 
 
 		 453 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.794472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5881  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  28.76 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4573  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.02 
 
 		 446 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3511  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  25.58 
 
 		 179 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1418  hypothetical protein  29.02 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0884  hypothetical protein  26.5 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3187  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  26.5 
 
 		 499 aa  57  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1892  hypothetical protein  26.5 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2030  hypothetical protein  26.5 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.350637  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3203  hypothetical protein  26.5 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2718  hypothetical protein  26.5 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.929618  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2546  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.5 
 
 		 475 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.644539 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3149  hypothetical protein  26.18 
 
 		 723 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2418  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  34.55 
 
 		 176 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1256  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.89 
 
 		 344 aa  53.1  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2417  hypothetical protein  26.88 
 
 		 508 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0810  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.18 
 
 		 480 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3930  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  27.37 
 
 		 480 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282648  normal  0.013766 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.81 
 
 		 327 aa  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.800081  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0355  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  25.87 
 
 		 520 aa  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541877  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0734  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  25.87 
 
 		 496 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0717  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  25.87 
 
 		 490 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482708  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0838  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  25.87 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0798  hypothetical protein  25.52 
 
 		 497 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.375789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2365  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.56 
 
 		 328 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3881  hypothetical protein  23.92 
 
 		 494 aa  47.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3440  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.48 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.93321  normal  0.103466 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0746  TRAP-T family transporter periplasmic substrate binding subunit  24.14 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.842378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3723  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.03 
 
 		 316 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4417  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.71 
 
 		 348 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0674202 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1890  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.33 
 
 		 333 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.966009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3267  hypothetical protein  31.13 
 
 		 323 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1252  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  21.05 
 
 		 323 aa  44.3  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4512  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.07 
 
 		 299 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3839  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.07 
 
 		 327 aa  43.5  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0135422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0608  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.65 
 
 		 326 aa  43.5  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.516133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0356  hypothetical protein  20.23 
 
 		 324 aa  43.1  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.097907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>