More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4706 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4706  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 108 aa  221  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  90.74 
 
 		 108 aa  201  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  90.74 
 
 		 108 aa  201  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  81.48 
 
 		 108 aa  179  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3547  transposase IS3/IS911 family protein  77.78 
 
 		 108 aa  173  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7787  transposase IS3/IS911 family protein  78.5 
 
 		 108 aa  165  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00188003  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  72.82 
 
 		 107 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  64.49 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  64.49 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  63.89 
 
 		 109 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  63.89 
 
 		 109 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  61.68 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  60.75 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4211  transposase IS3/IS911  64.81 
 
 		 109 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  63.81 
 
 		 109 aa  134  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  63.81 
 
 		 109 aa  134  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  64.08 
 
 		 110 aa  133  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  64.08 
 
 		 110 aa  133  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8266  hypothetical protein  62.86 
 
 		 109 aa  130  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  61.76 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  64.76 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  64.76 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  64.76 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  59.26 
 
 		 107 aa  123  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1752  transposase IS3 family protein  58.88 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1635  transposase IS3 family protein  58.88 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169974  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1596  transposase IS3 family protein  58.88 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2514  transposase IS3 family protein  58.88 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  58.65 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  58.65 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  60.4 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  60.4 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  60.4 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5123  transposase IS3/IS911  58.49 
 
 		 107 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5203  transposase IS3/IS911  58.49 
 
 		 107 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  54.63 
 
 		 108 aa  120  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  57.8 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  57.8 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  56.19 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4772  IS1203 transposase orfA  62.86 
 
 		 113 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371432  normal  0.791155 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0292  IS629, transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.642874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3515  IS629, transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0406871 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0053  IS629, transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4590  IS629, transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2933  IS629, transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  hitchhiker  0.0000000000000376997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2788  IS629, transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.253032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2844  IS629, transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.865071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3231  IS629, transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172275  hitchhiker  0.000705402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3873  IS629, transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.997702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3385  IS629, transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1177  IS629, transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1656  IS629, transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0042  IS629, transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2285  IS629, transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.113607  hitchhiker  0.00000000000000192514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1169  IS629, transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.481035 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5556  transposase IS3/IS911 family protein  53.7 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5345  transposase IS3/IS911 family protein  53.7 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4440  transposase IS3/IS911 family protein  53.7 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5065  transposase IS3/IS911 family protein  53.7 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0014  IS629, transposase orfA  60.95 
 
 		 108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  54.29 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0101  IS629 transposase orfA  63.81 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0789962  hitchhiker  0.0000515378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4790  IS1203 transposase orfA  63.81 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.336245 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2491  IS629, transposase orfA  63.81 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.99232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2666  IS629, transposase orfA  63.81 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331331 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0036  IS629, transposase orfA  63.81 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0989  IS629 transposase orfA  63.81 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1923  IS629 transposase orfA  63.81 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.968111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4764  IS1203 transposase orfA  63.81 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4643  IS629 transposase orfA  63.81 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1591  IS629 transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2259  IS629 transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1239  IS1203 transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1665  IS1203 transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0080  IS1203 transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000633207  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0296  IS629 transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000121277  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0060  IS629 transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0207  IS629 transposase orfA  62.86 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0027  IS629, transposase orfA  60.95 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4843  IS629, transposase orfA  61.9 
 
 		 108 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0246  IS629 transposase orfA  61.9 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0133  IS629 transposase orfA  61.9 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.743036  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0220  IS629 transposase orfA  60.95 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  55.56 
 
 		 492 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8280  hypothetical protein  56.82 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1285  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1796  transposase IS3/IS911 family protein  50.47 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0077  putative transposase family protein  63.53 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.302219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2976  Tn4652, transposase subunit A  54 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57447  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2097  hypothetical protein  47.47 
 
 		 102 aa  93.6  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230614  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11740  transposase  51.96 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.53193e-56  normal  0.308652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12113  transposase  51.96 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.72555e-57  normal  0.924844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11807  transposase  51.96 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.601339999999999e-45  hitchhiker  0.00672447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11347  transposase  51.96 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.3772600000000003e-34  normal  0.888349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11781  transposase  51.96 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.66965e-85  hitchhiker  0.000000000569119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11791  transposase  51.96 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.324620000000001e-61  hitchhiker  0.00000385538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12049  transposase  51.96 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.40799e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11784  transposase  51.96 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.00725e-90  hitchhiker  0.0000000133913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>