More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4674 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  57.5 
 
 		 593 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  57.84 
 
 		 594 aa  692    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  56.25 
 
 		 600 aa  646    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  61.21 
 
 		 594 aa  709    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  57.84 
 
 		 594 aa  680    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 592 aa  1170    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  53.87 
 
 		 599 aa  611  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  55.63 
 
 		 601 aa  580  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  51.64 
 
 		 624 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  55.01 
 
 		 607 aa  571  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  51.72 
 
 		 609 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  53.42 
 
 		 594 aa  557  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  53.05 
 
 		 615 aa  543  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  49.84 
 
 		 613 aa  544  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  54.65 
 
 		 593 aa  539  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3004  Gamma-glutamyltransferase  54.49 
 
 		 612 aa  537  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  53.34 
 
 		 616 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  52.07 
 
 		 597 aa  508  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0148  Gamma-glutamyltransferase  53.24 
 
 		 601 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  35.39 
 
 		 586 aa  275  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  35.13 
 
 		 573 aa  253  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  32.62 
 
 		 563 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  31.78 
 
 		 564 aa  247  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3078  gamma-glutamyltransferase 2  33.62 
 
 		 562 aa  243  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  34.09 
 
 		 593 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  33.1 
 
 		 630 aa  240  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  32.14 
 
 		 563 aa  239  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  32.62 
 
 		 579 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  30.44 
 
 		 642 aa  237  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  31.78 
 
 		 545 aa  237  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  31.6 
 
 		 568 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  31.24 
 
 		 570 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  31.24 
 
 		 570 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  31.24 
 
 		 570 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  31.12 
 
 		 565 aa  233  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  30.7 
 
 		 570 aa  233  6e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  31.06 
 
 		 570 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  31.6 
 
 		 570 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  31.6 
 
 		 570 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  31.6 
 
 		 570 aa  232  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  34.53 
 
 		 543 aa  226  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  32.84 
 
 		 534 aa  223  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  29.87 
 
 		 590 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  29.67 
 
 		 643 aa  216  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  31.1 
 
 		 576 aa  216  9e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  31.25 
 
 		 553 aa  210  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  34.13 
 
 		 531 aa  207  5e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  33.03 
 
 		 527 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  32.54 
 
 		 526 aa  204  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  30 
 
 		 541 aa  203  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  31.43 
 
 		 512 aa  203  9e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  31.14 
 
 		 601 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  32.81 
 
 		 533 aa  200  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  32.3 
 
 		 536 aa  199  9e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  28.6 
 
 		 586 aa  197  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  30.34 
 
 		 565 aa  196  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  31.28 
 
 		 536 aa  194  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  31.38 
 
 		 533 aa  193  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  27.89 
 
 		 587 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  31.68 
 
 		 525 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  27.72 
 
 		 587 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  30.81 
 
 		 542 aa  190  5e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  27.72 
 
 		 587 aa  191  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  34.62 
 
 		 542 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  30.39 
 
 		 531 aa  190  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  34.98 
 
 		 542 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  28.05 
 
 		 530 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  26.2 
 
 		 604 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  32.99 
 
 		 525 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  32.2 
 
 		 525 aa  187  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  28.64 
 
 		 587 aa  186  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  30.8 
 
 		 558 aa  184  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  27.82 
 
 		 581 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  26.6 
 
 		 556 aa  184  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  27.96 
 
 		 597 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  26.5 
 
 		 556 aa  183  6e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  27.79 
 
 		 592 aa  183  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  29.85 
 
 		 580 aa  183  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  28.64 
 
 		 576 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  32.59 
 
 		 538 aa  182  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  29.67 
 
 		 535 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  27.47 
 
 		 583 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  31.02 
 
 		 549 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  31.5 
 
 		 539 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  28.14 
 
 		 561 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  27.3 
 
 		 583 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  32.35 
 
 		 531 aa  180  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  28.32 
 
 		 583 aa  180  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  27.13 
 
 		 587 aa  180  8e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  31.02 
 
 		 539 aa  180  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  29.58 
 
 		 529 aa  178  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  30.69 
 
 		 525 aa  178  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6704  putative gamma-glutamyltranspeptidase  29.79 
 
 		 557 aa  178  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450418 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  31.41 
 
 		 540 aa  177  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  28.52 
 
 		 534 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  29.19 
 
 		 529 aa  176  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  27.57 
 
 		 592 aa  176  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  31.57 
 
 		 568 aa  176  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  29.67 
 
 		 587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  27.81 
 
 		 576 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>