More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4635 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  79.43 
 
 		 154 aa  205  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  60 
 
 		 166 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  66.19 
 
 		 168 aa  159  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 151 aa  158  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 151 aa  158  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  53.42 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  52.82 
 
 		 154 aa  157  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  54.17 
 
 		 154 aa  157  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  54.74 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  55.94 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 153 aa  151  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  56.39 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  49.02 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  46.1 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  46.1 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  46.1 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  46.1 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  54.14 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  56.03 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  45.39 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  44.68 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  67.65 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  57.6 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  65.74 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  65.74 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  53.19 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  53.08 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 151 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  53.08 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  60.95 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  50.39 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  50.39 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  51.47 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  45.7 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  48.09 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  51.24 
 
 		 143 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 159 aa  133  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  50 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 267 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  51.16 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  47.76 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  50.41 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  48.87 
 
 		 152 aa  130  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 149 aa  130  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  48.91 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  51.16 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  48.2 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  51.16 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 161 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0676  MarR family transcriptional regulator  68.93 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  49.64 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  46.62 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  48.15 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  46.62 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 154 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  45.52 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  50.86 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  52.1 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  43.48 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  48.48 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>