More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4598 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  83.97 
 
 		 583 aa  895    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 581 aa  1124    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  56.79 
 
 		 598 aa  571  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  57.77 
 
 		 577 aa  555  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3155  cyclic nucleotide-binding protein  38.92 
 
 		 599 aa  330  4e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  36.52 
 
 		 584 aa  301  3e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3179  cyclic nucleotide-binding protein  37.37 
 
 		 639 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  31.55 
 
 		 621 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.28 
 
 		 624 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.81 
 
 		 597 aa  223  9e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  30.86 
 
 		 583 aa  213  9e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 748 aa  203  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  32.8 
 
 		 1048 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  31.73 
 
 		 1065 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18298  predicted protein  31.92 
 
 		 1275 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02481  Lysophospholipase nte1 (EC 3.1.1.5)(Neuropathy target esterase homolog)(Intracellular phospholipase B) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAE9]  26.01 
 
 		 1408 aa  160  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0963788  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04180  hydrolase, putative  27.24 
 
 		 1588 aa  160  5e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33358  predicted protein  25.14 
 
 		 1546 aa  155  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.176236 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  29 
 
 		 594 aa  153  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  38.28 
 
 		 327 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  33.22 
 
 		 323 aa  127  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  33.56 
 
 		 323 aa  127  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30628  predicted protein  26.69 
 
 		 1085 aa  125  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  33.95 
 
 		 320 aa  124  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  33.95 
 
 		 320 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  34.32 
 
 		 315 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  30.48 
 
 		 315 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  34.32 
 
 		 315 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  41.44 
 
 		 259 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  32.62 
 
 		 276 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  40.78 
 
 		 335 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  31.32 
 
 		 333 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  31.32 
 
 		 320 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  33.21 
 
 		 314 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  31.32 
 
 		 320 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  29.13 
 
 		 287 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  41.62 
 
 		 300 aa  114  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  39.67 
 
 		 335 aa  114  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  34.15 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  28.72 
 
 		 311 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  43.58 
 
 		 343 aa  112  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  34.86 
 
 		 263 aa  112  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  25.27 
 
 		 263 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  29.3 
 
 		 250 aa  110  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  35.23 
 
 		 327 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  31.47 
 
 		 326 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  40.54 
 
 		 323 aa  110  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  34.86 
 
 		 263 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  34.04 
 
 		 252 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  33.65 
 
 		 760 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  29.15 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  34.29 
 
 		 263 aa  108  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  32.8 
 
 		 256 aa  108  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  35.64 
 
 		 324 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4027  patatin  36.73 
 
 		 345 aa  107  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.353324  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  34.54 
 
 		 305 aa  107  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  34.48 
 
 		 341 aa  107  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  34.29 
 
 		 263 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  39.78 
 
 		 317 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  34.86 
 
 		 263 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  34.86 
 
 		 263 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  34.86 
 
 		 263 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  40.33 
 
 		 317 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  34.29 
 
 		 263 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  38.17 
 
 		 316 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  34.29 
 
 		 263 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  34.29 
 
 		 263 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  38.17 
 
 		 316 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  33.02 
 
 		 751 aa  105  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  30.47 
 
 		 321 aa  105  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2456  patatin  37.89 
 
 		 336 aa  104  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1747  patatin  36.73 
 
 		 346 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400605 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  32.38 
 
 		 738 aa  104  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  38.67 
 
 		 301 aa  104  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3633  hypothetical protein  35.98 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43300  hypothetical protein  35.98 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.882188  normal  0.835077 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2188  putative phospholipase  37.84 
 
 		 293 aa  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3464  patatin  36.22 
 
 		 346 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102358 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  38.55 
 
 		 323 aa  103  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  25.08 
 
 		 740 aa  103  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  38.38 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  34.91 
 
 		 735 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2469  patatin  39.51 
 
 		 347 aa  103  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.504238  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  32.6 
 
 		 260 aa  103  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2305  patatin  35.71 
 
 		 348 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00029553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  35.8 
 
 		 293 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  28.57 
 
 		 273 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  39.77 
 
 		 308 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  31.9 
 
 		 738 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  32.38 
 
 		 738 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  31.46 
 
 		 754 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  37.57 
 
 		 253 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4687  patatin  36.93 
 
 		 333 aa  102  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  32.38 
 
 		 738 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  32.39 
 
 		 737 aa  101  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  32.38 
 
 		 738 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1907  patatin  34.69 
 
 		 346 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331125  hitchhiker  0.00000758802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01210  hypothetical protein  35.96 
 
 		 314 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.287845  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  32.38 
 
 		 738 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2204  hypothetical protein  37.43 
 
 		 316 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>