More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4503 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4503  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 384 aa  763    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  92.66 
 
 		 385 aa  628  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206378  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  77.71 
 
 		 446 aa  535  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  77.13 
 
 		 441 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  77.13 
 
 		 441 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  74.72 
 
 		 447 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  70.13 
 
 		 398 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2680  secretion protein HlyD  56.03 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.957988  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6004  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  53.62 
 
 		 378 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00823963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3539  secretion protein HlyD  53.21 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6935  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  50.95 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4027  secretion protein HlyD  53.74 
 
 		 399 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  48.99 
 
 		 406 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  50.94 
 
 		 386 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  51.15 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3781  secretion protein HlyD  54.14 
 
 		 398 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.012367 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5495  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.58 
 
 		 384 aa  341  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318515  normal  0.60957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.78 
 
 		 399 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2742  secretion protein HlyD  51.19 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3015  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.74 
 
 		 384 aa  335  9e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  49.32 
 
 		 385 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  47.76 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4427  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.23 
 
 		 394 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  47.81 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  49.33 
 
 		 430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3329  secretion protein HlyD  51.16 
 
 		 386 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.86 
 
 		 390 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.57 
 
 		 424 aa  322  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  45.82 
 
 		 425 aa  322  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.86 
 
 		 392 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.48 
 
 		 395 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  47.17 
 
 		 405 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.67 
 
 		 422 aa  318  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  48.8 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  49 
 
 		 434 aa  316  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  48.79 
 
 		 391 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.15 
 
 		 423 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.15 
 
 		 469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  47.63 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.3 
 
 		 411 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  48.85 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.52 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  47.85 
 
 		 415 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  45.74 
 
 		 386 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  50.58 
 
 		 391 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  46.51 
 
 		 424 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.72 
 
 		 391 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  46.79 
 
 		 433 aa  312  7.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  49.06 
 
 		 398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  50.43 
 
 		 391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  46.36 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  46.36 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  46.3 
 
 		 412 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  46.3 
 
 		 412 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.12 
 
 		 410 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2941  RND family efflux transporter MFP subunit  49.06 
 
 		 397 aa  308  8e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  46.2 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  48.87 
 
 		 412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.2 
 
 		 384 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  45.07 
 
 		 442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  45.07 
 
 		 383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  46.2 
 
 		 384 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  44.69 
 
 		 395 aa  304  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  47.27 
 
 		 394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  46.81 
 
 		 381 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  46.44 
 
 		 431 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.33 
 
 		 436 aa  301  9e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  45.92 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  44.11 
 
 		 388 aa  301  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  45.72 
 
 		 412 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  44.11 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  46.07 
 
 		 420 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  44.11 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  45.8 
 
 		 420 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  45.8 
 
 		 420 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  45.8 
 
 		 420 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  45.8 
 
 		 420 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  45.8 
 
 		 420 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  46.38 
 
 		 400 aa  300  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  45.53 
 
 		 420 aa  299  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  45.45 
 
 		 418 aa  298  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.48 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  44.14 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  45.53 
 
 		 420 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  46.59 
 
 		 409 aa  296  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  43.75 
 
 		 386 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  45.05 
 
 		 381 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  47.65 
 
 		 409 aa  296  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.87 
 
 		 386 aa  295  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  43.6 
 
 		 386 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  46.32 
 
 		 409 aa  295  7e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  46.32 
 
 		 397 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.32 
 
 		 397 aa  295  8e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  46.32 
 
 		 397 aa  295  8e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  46.32 
 
 		 397 aa  295  8e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  46.32 
 
 		 397 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  46.32 
 
 		 397 aa  295  8e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  46.03 
 
 		 387 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  46.32 
 
 		 409 aa  295  9e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  44.41 
 
 		 405 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>