More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4346 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4346  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0473  hypothetical protein  80.63 
 
 
201 aa  248  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3514  protein of unknown function DUF205  79.49 
 
 
202 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3314  hypothetical protein  79.49 
 
 
202 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3637  protein of unknown function DUF205  77.95 
 
 
202 aa  240  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.646526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  65.83 
 
 
203 aa  234  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  68.78 
 
 
196 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  69.47 
 
 
196 aa  228  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  62.5 
 
 
201 aa  220  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4727  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  65.96 
 
 
198 aa  217  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2284  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  70.74 
 
 
198 aa  214  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.278877  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1760  hypothetical protein  61.19 
 
 
209 aa  211  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1357  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  66.15 
 
 
203 aa  207  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1389  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  62.3 
 
 
206 aa  207  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.942836  normal  0.154079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3030  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  68.42 
 
 
196 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  64.21 
 
 
197 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1297  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  61.78 
 
 
206 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114938  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0601  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  64.58 
 
 
201 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0566  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  64.06 
 
 
201 aa  200  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3312  protein of unknown function DUF205  86.67 
 
 
200 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3529  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  62.76 
 
 
203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.536272  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3856  protein of unknown function DUF205  58.88 
 
 
204 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0565232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  58.08 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  56.7 
 
 
201 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  56.7 
 
 
201 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  55.14 
 
 
210 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3420  hypothetical protein  63.73 
 
 
197 aa  174  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296095  normal  0.610432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3095  protein of unknown function DUF205  56.99 
 
 
203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0484205  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  57.71 
 
 
212 aa  167  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3917  hypothetical protein  65.1 
 
 
202 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  59.68 
 
 
194 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1715  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  56.52 
 
 
216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.23261  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3073  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  58.06 
 
 
202 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  48.17 
 
 
211 aa  159  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1509  hypothetical protein  56.54 
 
 
215 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0027  membrane protein  41.08 
 
 
195 aa  151  7e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  50.52 
 
 
203 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0007  membrane protein  42.02 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.386788  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.63 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0740  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.69 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1208  hypothetical protein  54.3 
 
 
200 aa  144  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.12 
 
 
210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3906  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  53.07 
 
 
203 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.676022  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  47.85 
 
 
194 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0533  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.47 
 
 
198 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  49.47 
 
 
197 aa  142  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2382  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.59 
 
 
200 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.332777 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5888  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  49.74 
 
 
212 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  43.69 
 
 
224 aa  142  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  48.62 
 
 
193 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2062  hypothetical protein  47.62 
 
 
202 aa  141  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3192  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  56.25 
 
 
216 aa  141  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1070  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.81 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  45.6 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0918  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.81 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2604  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  49.23 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0914  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.81 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.25 
 
 
215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2475  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  49.23 
 
 
212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0301507 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0672  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.81 
 
 
203 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0372  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.81 
 
 
203 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0121  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.81 
 
 
203 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2507  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.81 
 
 
203 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0517  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.31 
 
 
202 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0870487  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  47.51 
 
 
193 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0040  hypothetical protein  47.64 
 
 
197 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0729  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.81 
 
 
202 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2580  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.98 
 
 
208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0155  protein of unknown function DUF205  48.4 
 
 
208 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.337449 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1945  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.47 
 
 
213 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2556  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.47 
 
 
213 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477971  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  46.38 
 
 
226 aa  134  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1800  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  55.68 
 
 
197 aa  134  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428645  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  45.41 
 
 
195 aa  134  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0575  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.84 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  45.64 
 
 
198 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0293  hypothetical protein  45.41 
 
 
210 aa  132  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1851  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.81 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2521  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.59 
 
 
203 aa  131  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.635021 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  43.78 
 
 
200 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  51.98 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2760  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.22 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.44 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1811  hypothetical protein  42.27 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  47.51 
 
 
194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0320  protein of unknown function DUF205  42.36 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.254648  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0753  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.31 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3209  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.56 
 
 
214 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468969  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2823  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.56 
 
 
207 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.571241 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001618  acyl-phosphate:glycerol-3-phosphate O-acyltransferase PlsY  42.86 
 
 
203 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0411697  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2243  protein of unknown function DUF205  41.67 
 
 
211 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.341308  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2417  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.56 
 
 
207 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4637  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.62 
 
 
192 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.31 
 
 
212 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2753  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.67 
 
 
206 aa  122  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3467  hypothetical protein  45.5 
 
 
213 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2989  hypothetical protein  44.62 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  46.56 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2546  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.21 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  45.83 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>