21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4290 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4290  hypothetical protein  100 
 
 
669 aa  1364    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3371  hypothetical protein  68.66 
 
 
437 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3046  hypothetical protein  28.69 
 
 
504 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.117298  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0011  hypothetical protein  23.06 
 
 
1227 aa  89.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5420  hypothetical protein  29.17 
 
 
1170 aa  84  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2179  hypothetical protein  30.32 
 
 
1010 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019283 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4775  hypothetical protein  26.18 
 
 
1034 aa  74.7  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527155  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2115  hypothetical protein  28 
 
 
1009 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1772  hypothetical protein  28.22 
 
 
1039 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2159  hypothetical protein  28.36 
 
 
1009 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135027  normal  0.649366 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0078  hypothetical protein  24.72 
 
 
962 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.253673 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3045  Signal recognition particle GTPase  42.71 
 
 
514 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.698368  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1066  hypothetical protein  28.04 
 
 
1015 aa  65.1  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619549  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4533  hypothetical protein  24.15 
 
 
1403 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0371536  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5286  hypothetical protein  27.55 
 
 
971 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.55512  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3915  hypothetical protein  27.82 
 
 
1283 aa  63.9  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2633  hypothetical protein  26.74 
 
 
999 aa  63.9  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.753628  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2433  hypothetical protein  27.82 
 
 
1387 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0044  hypothetical protein  25.95 
 
 
967 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0281  hypothetical protein  25.95 
 
 
1065 aa  60.5  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503422  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5619  hypothetical protein  24.38 
 
 
1003 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>