43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4237 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  100 
 
 
311 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3644  methyltransferase type 11  49.01 
 
 
296 aa  275  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
324 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2045  methyltransferase type 11  44.38 
 
 
358 aa  133  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029361  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3647  methyltransferase type 11  39.64 
 
 
242 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3940  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 
242 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  36.96 
 
 
233 aa  95.5  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  34.06 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6925  hypothetical protein  43.43 
 
 
574 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.487787 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0397  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1204  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 
223 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19766  normal  0.871669 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2515  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  32.71 
 
 
1082 aa  67  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  32.61 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  33.93 
 
 
668 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
324 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
228 aa  60.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  43.04 
 
 
1476 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
242 aa  58.9  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 
511 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  27.27 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  31.67 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3844  Methyltransferase type 11  24.82 
 
 
192 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2348  hypothetical protein  31.4 
 
 
220 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  26.24 
 
 
238 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  39.73 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  42.03 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  23.44 
 
 
181 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3459  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
866 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0352711  normal  0.0439165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
212 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  29.41 
 
 
870 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  26.8 
 
 
189 aa  47  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  32.76 
 
 
240 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  24.34 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.6 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  30.14 
 
 
1124 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  43.18 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  27.03 
 
 
239 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
235 aa  42.4  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>