163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4230 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  80.41 
 
 		 252 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  61.18 
 
 		 255 aa  299  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  63.03 
 
 		 283 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  62.18 
 
 		 271 aa  278  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  63.76 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  57.37 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  56 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  54.51 
 
 		 261 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  55.28 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  55.26 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  55.7 
 
 		 263 aa  240  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  54.62 
 
 		 647 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  51.15 
 
 		 277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  53.88 
 
 		 265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  55.7 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  56.97 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  50.58 
 
 		 274 aa  235  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  50.4 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  50.63 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  55.65 
 
 		 258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  54.59 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  50.22 
 
 		 272 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  49.61 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  54.5 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  48.64 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  50.43 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  50.43 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  47.81 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  45.38 
 
 		 256 aa  185  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  47.44 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  45.3 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  47.88 
 
 		 252 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  43.83 
 
 		 247 aa  172  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  37.29 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  44.44 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  35.24 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  49.78 
 
 		 244 aa  162  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  35.68 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  43.11 
 
 		 248 aa  149  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  35.48 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  33.63 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  33.63 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  46.36 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  26.52 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  25.93 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  26.34 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  30 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  33.03 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_003296  RS03173  hypothetical protein  38.05 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.188182 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.32 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  30.11 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  27.69 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  30.29 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.32 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  30.81 
 
 		 397 aa  52.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  34.96 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  33.33 
 
 		 387 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  31.22 
 
 		 321 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  27.54 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  30.04 
 
 		 376 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3950  alpha/beta hydrolase fold  42.22 
 
 		 295 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0198056  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  36.61 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  47.83 
 
 		 387 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3452  hypothetical protein  24.04 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281711  normal  0.0529388 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  27.96 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  46.97 
 
 		 387 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  36.61 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0661  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  35.38 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0368056  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.97 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07480  hypothetical protein  23.11 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  37.31 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  28.69 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  33.69 
 
 		 410 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  27.8 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.39 
 
 		 369 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  40.86 
 
 		 580 aa  46.2  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  34.15 
 
 		 374 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4198  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4168  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712942 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  28.16 
 
 		 277 aa  45.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  38.55 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  40.58 
 
 		 290 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  30.25 
 
 		 338 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  31.82 
 
 		 409 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  47.76 
 
 		 387 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  28.18 
 
 		 258 aa  45.4  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  27.22 
 
 		 264 aa  45.4  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.03 
 
 		 371 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  49.21 
 
 		 415 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2227  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>