99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4227 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4227  carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 498 aa  996    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796044  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4737  Carbohydrate-selective porin OprB  87.05 
 
 		 502 aa  884    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0100904  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1762  Carbohydrate-selective porin OprB  66.52 
 
 		 446 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1384  carbohydrate-selective porin OprB  58.03 
 
 		 490 aa  548  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262831 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1380  Carbohydrate-selective porin OprB  57.52 
 
 		 522 aa  549  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.768391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1659  Carbohydrate-selective porin OprB  57.63 
 
 		 490 aa  547  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2894  Carbohydrate-selective porin OprB  56.22 
 
 		 509 aa  535  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0870  carbohydrate-selective porin OprB  59.92 
 
 		 481 aa  532  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  hitchhiker  0.00100235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2771  carbohydrate-selective porin OprB  56.25 
 
 		 534 aa  531  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2998  Carbohydrate-selective porin OprB  55.35 
 
 		 534 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0904  Carbohydrate-selective porin OprB  46.98 
 
 		 481 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0673705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2969  carbohydrate-selective porin OprB  44.82 
 
 		 480 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1735  carbohydrate-selective porin OprB  47.34 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0819299 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1063  Carbohydrate-selective porin OprB  42.54 
 
 		 473 aa  350  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.659002 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0296  carbohydrate porin  42.12 
 
 		 504 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2652  carbohydrate porin  42.12 
 
 		 504 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.486905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0309  carbohydrate porin  42.12 
 
 		 504 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2070  carbohydrate porin  42.12 
 
 		 504 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3023  carbohydrate porin  42.12 
 
 		 504 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3354  carbohydrate porin  42.12 
 
 		 504 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0489  carbohydrate porin  42.12 
 
 		 504 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0267  carbohydrate porin  41.55 
 
 		 514 aa  319  6e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3503  carbohydrate-selective porin OprB  41.75 
 
 		 514 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4863  carbohydrate-selective porin OprB  41.75 
 
 		 514 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4759  carbohydrate-selective porin OprB  39.65 
 
 		 494 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.15964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5422  carbohydrate-selective porin OprB  41.27 
 
 		 493 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585602  normal  0.389505 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4236  carbohydrate-selective porin OprB  40.57 
 
 		 492 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.269576 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0852  carbohydrate-selective porin OprB  39.86 
 
 		 495 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4831  Carbohydrate-selective porin OprB  39.54 
 
 		 507 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0156749  normal  0.100608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1832  carbohydrate porin  36.98 
 
 		 474 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.378247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3558  carbohydrate-selective porin OprB  37.95 
 
 		 534 aa  298  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4004  carbohydrate-selective porin OprB  39.2 
 
 		 483 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3953  carbohydrate-selective porin OprB  39.14 
 
 		 488 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268403  normal  0.112791 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2156  carbohydrate-selective porin OprB  36.22 
 
 		 478 aa  279  9e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3629  carbohydrate-selective porin OprB  38.37 
 
 		 444 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419401  decreased coverage  0.00176786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2528  Carbohydrate-selective porin OprB  36.38 
 
 		 502 aa  257  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.310329 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1597  carbohydrate-selective porin OprB  31.87 
 
 		 480 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0966255  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1331  carbohydrate-selective porin OprB  30.34 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901069  hitchhiker  0.00588319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1190  Carbohydrate-selective porin OprB  29.34 
 
 		 501 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01615  regulator of pathogenicity factors  25.97 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00130056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4576  carbohydrate-selective porin OprB  26.65 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3835  Carbohydrate-selective porin OprB  27.25 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.899229 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4912  Carbohydrate-selective porin OprB  27.25 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00363735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00490  regulator of pathogenicity factors  25.85 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2033  Carbohydrate-selective porin OprB  26.96 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34960  glucose-sensitive porin  24.1 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000209451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23030  glucose/carbohydrate outer membrane porin OprB precursor  24.1 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0211738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2950  glucose-sensitive porin  23.87 
 
 		 452 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.393124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4366  carbohydrate-selective porin OprB  25.17 
 
 		 448 aa  104  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00370105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1943  outer membrane porin OprB precursor  23.87 
 
 		 454 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1019  porin B  25.48 
 
 		 447 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1057  carbohydrate-selective porin OprB  25.48 
 
 		 447 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177917  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1632  putative porin B precursor outer (glucose porin) transmembrane protein  27.42 
 
 		 456 aa  103  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1445  porin B  25.72 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.374886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1017  carbohydrate-selective porin OprB  25 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.134295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1082  carbohydrate-selective porin OprB  25.35 
 
 		 448 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0774059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4360  carbohydrate-selective porin OprB  25.28 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.081551  normal  0.195321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4205  carbohydrate-selective porin OprB  24.82 
 
 		 447 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4276  carbohydrate-selective porin OprB  24.77 
 
 		 444 aa  100  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.308576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2150  Carbohydrate-selective porin OprB  26.38 
 
 		 418 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000322479  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2522  carbohydrate-selective porin, OprB family  26.38 
 
 		 418 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0118751  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1117  carbohydrate-selective porin OprB  23.95 
 
 		 453 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00415727  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1296  porin B  23.96 
 
 		 453 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329329  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2869  Carbohydrate-selective porin OprB  25.69 
 
 		 490 aa  96.7  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.206481 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1771  Carbohydrate-selective porin OprB  28.49 
 
 		 395 aa  91.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.799068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4200  Carbohydrate-selective porin OprB  25.84 
 
 		 482 aa  89  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2178  carbohydrate-selective porin OprB  23.45 
 
 		 396 aa  86.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278032  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2860  carbohydrate-selective porin OprB  24.67 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00385913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2351  carbohydrate-selective porin OprB  26.51 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.348926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2711  carbohydrate-selective porin OprB  26.34 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.695739  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2204  carbohydrate-selective porin OprB  26.51 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3070  carbohydrate-selective porin OprB  24.67 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.681986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2838  carbohydrate-selective porin OprB  24.67 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2957  carbohydrate-selective porin OprB  26.57 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0154  Carbohydrate-selective porin OprB  27.11 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.858222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3570  carbohydrate-selective porin OprB  26.11 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1898  Carbohydrate-selective porin OprB  25.84 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.541333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2250  carbohydrate-selective porin, OprB family  25.84 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5436  carbohydrate-selective porin, OprB family  25.39 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390026  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0854  Carbohydrate-selective porin OprB  24.8 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.648225 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3047  carbohydrate-selective porin OprB  26.09 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.854363  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1115  Carbohydrate-selective porin OprB  24.69 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.967056  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1821  Carbohydrate-selective porin OprB  24.27 
 
 		 486 aa  70.1  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1247  Carbohydrate-selective porin OprB  22.57 
 
 		 512 aa  62.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1477  Carbohydrate-selective porin OprB  22.2 
 
 		 462 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3564  Carbohydrate-selective porin OprB  23.16 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1436  Carbohydrate-selective porin OprB  22.75 
 
 		 481 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1274  carbohydrate-selective porin OprB  22.75 
 
 		 494 aa  52  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1290  Carbohydrate-selective porin OprB  23.16 
 
 		 492 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4992  Carbohydrate-selective porin OprB  25.51 
 
 		 498 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000230615  hitchhiker  0.00966153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3682  Carbohydrate-selective porin OprB  21.97 
 
 		 486 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3489  carbohydrate-selective porin OprB  23.29 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2286  Carbohydrate-selective porin OprB  28.43 
 
 		 703 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.725177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3373  carbohydrate-selective porin OprB  21.97 
 
 		 486 aa  44.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2536  Carbohydrate-selective porin OprB  25.51 
 
 		 498 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.761533 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3871  Carbohydrate-selective porin OprB  23.64 
 
 		 484 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0231495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3797  Carbohydrate-selective porin OprB  23.06 
 
 		 484 aa  44.3  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  26.5 
 
 		 693 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2010  carbohydrate-selective porin OprB  27.94 
 
 		 703 aa  43.1  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>