29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4120 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4120  hypothetical protein  100 
 
 		 1371 aa  2653    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.189457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2438  hypothetical protein  50 
 
 		 840 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  47.9 
 
 		 555 aa  202  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  47.9 
 
 		 555 aa  202  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  48.1 
 
 		 555 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  48.1 
 
 		 555 aa  200  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  48.1 
 
 		 554 aa  199  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1998  hypothetical protein  40.34 
 
 		 497 aa  97.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0054926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1761  hypothetical protein  34.59 
 
 		 805 aa  79.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5633  hypothetical protein  36.28 
 
 		 866 aa  65.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4392  hypothetical protein  44.21 
 
 		 1049 aa  63.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2288  phage tail fiber protein  49.18 
 
 		 546 aa  58.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  51.43 
 
 		 691 aa  58.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2472  triple helix repeat-containing collagen  51.85 
 
 		 183 aa  57.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  51.61 
 
 		 2914 aa  57.4  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  39.13 
 
 		 400 aa  53.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  41.89 
 
 		 2851 aa  52.8  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  58.7 
 
 		 1426 aa  52.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  59.46 
 
 		 403 aa  52.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  47.06 
 
 		 439 aa  52  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  47.06 
 
 		 437 aa  52  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  61.22 
 
 		 839 aa  51.6  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  42.86 
 
 		 319 aa  52  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2770  tail fiber domain-containing protein  34.52 
 
 		 367 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00369502  normal  0.0266249 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  38.46 
 
 		 382 aa  48.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5675  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1065 aa  47  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6234  putative collagen-like protein  46.81 
 
 		 180 aa  47.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  43.55 
 
 		 645 aa  46.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  37.21 
 
 		 222 aa  46.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>