More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4044 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
283 aa  535  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7194  ABC transporter permease  65.83 
 
 
293 aa  351  8e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.34 
 
 
301 aa  304  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3186  ABC transporter permease  56.83 
 
 
283 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 
275 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2421  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  44.87 
 
 
291 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.662155  normal  0.855546 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.15 
 
 
288 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3395  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  38.93 
 
 
290 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445606  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.21 
 
 
275 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.700172  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7602  ABC transporter membrane spanning protein  43.3 
 
 
275 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.86 
 
 
308 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1480  ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 
276 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00172714  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
284 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125571  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.807342  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2224  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  33.07 
 
 
281 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1936  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potB)-like protein  33.47 
 
 
281 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8171  ABC transporter membrane spanning protein  38.1 
 
 
289 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6501  ABC transporter permease  37.64 
 
 
285 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126106  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
295 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
296 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.15 
 
 
593 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
282 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0280655 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3517  ABC polyamine/opine transporter, inner membrane subunit  38.93 
 
 
282 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
278 aa  158  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
289 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
290 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62757  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2707  ABC transporter membrane spanning protein (mannopine)  35.71 
 
 
259 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139329  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8305  ABC transporter membrane spanning protein (mannopine)  34.67 
 
 
285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
274 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.301683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
302 aa  152  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
290 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
285 aa  152  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.844332  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 
313 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.361491  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
290 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0489699  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
322 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0981  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.7 
 
 
299 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
274 aa  149  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0620959  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7681  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  36.79 
 
 
297 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.962209  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
323 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02288  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  30.97 
 
 
286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00131219  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
596 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04240  putative permease of ABC transporter  34.59 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003482  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotB  30.97 
 
 
286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000668861  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
291 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2812  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  31.97 
 
 
328 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1950  putrescine ABC transporter, permease protein  33.47 
 
 
326 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443162  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
328 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833701  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1038  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  31.86 
 
 
286 aa  145  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702638  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
328 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
328 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6347  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  31.97 
 
 
328 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1581  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  30.42 
 
 
285 aa  145  8.000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0724  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  32.71 
 
 
326 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0632  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  32.71 
 
 
326 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
301 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125858  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
305 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.167031  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
331 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
293 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
331 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
287 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18822  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2018  putrescine ABC transport system, permease protein  32.34 
 
 
326 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
274 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000217072  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
290 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0269803  normal  0.404001 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0871  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  37.86 
 
 
284 aa  143  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0342  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
285 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1272  polyamine ABC transporter, permease protein  32.58 
 
 
301 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
290 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.150151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0497  spermidine/putrescine ABC transporter permease  34.24 
 
 
288 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal  0.264404 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4006  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  31.06 
 
 
282 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  hitchhiker  0.00000000961653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1338  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  31.06 
 
 
282 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
268 aa  142  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
292 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1106  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  38.07 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0521412  hitchhiker  0.0000000382912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1599  spermidine/putrescine transport system permease protein  34.8 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120621  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 
283 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
326 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
324 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.93633  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
326 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0938  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit PotH  30.86 
 
 
324 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123183  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
301 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0057841  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
301 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0768287  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
312 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
301 aa  139  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0587247  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
287 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
299 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0425652 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
283 aa  138  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
293 aa  138  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0394  polyamine transport protein PotH  32.3 
 
 
303 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
302 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2704  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  34.21 
 
 
290 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382039  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
299 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>