219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3986 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
535 aa  1091    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  35.53 
 
 
1119 aa  252  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  37.64 
 
 
956 aa  248  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
994 aa  229  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  35.48 
 
 
537 aa  210  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  30.87 
 
 
860 aa  204  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 
456 aa  203  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  32.6 
 
 
537 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  34.72 
 
 
700 aa  196  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 
703 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  33.05 
 
 
443 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
1340 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
443 aa  179  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
902 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
499 aa  171  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
1156 aa  144  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1770  putative glycosyltransferase  27.62 
 
 
419 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2643  hypothetical protein  26.85 
 
 
429 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
410 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
419 aa  134  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
1106 aa  134  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  44.29 
 
 
849 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
414 aa  133  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  26.76 
 
 
419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02426  putative glycosyltransferase  28.48 
 
 
423 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  39.72 
 
 
1067 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
691 aa  120  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 
691 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  27.99 
 
 
407 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  28.49 
 
 
402 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  45.61 
 
 
1152 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  39.87 
 
 
1152 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  28.53 
 
 
691 aa  115  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  41.55 
 
 
1044 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07620  hypothetical protein  23.08 
 
 
410 aa  113  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.71 
 
 
1366 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  25.46 
 
 
892 aa  111  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  35.84 
 
 
857 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
432 aa  107  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 
824 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
389 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  30.08 
 
 
442 aa  104  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 
410 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  44.12 
 
 
746 aa  102  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  49.02 
 
 
521 aa  101  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  40.17 
 
 
872 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
406 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  38.62 
 
 
597 aa  99  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88208  predicted protein  32.14 
 
 
476 aa  97.8  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0321312  normal  0.112837 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  24.35 
 
 
402 aa  96.7  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  40.85 
 
 
223 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
683 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  42.5 
 
 
1247 aa  94.7  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  37.86 
 
 
235 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  29.09 
 
 
413 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 
435 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  27.14 
 
 
414 aa  91.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
405 aa  91.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 
411 aa  91.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
405 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
665 aa  90.5  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
436 aa  90.5  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  37.42 
 
 
434 aa  90.5  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  32.93 
 
 
402 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  28.95 
 
 
397 aa  89.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  45.36 
 
 
2342 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  45.36 
 
 
2342 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
1152 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  31.21 
 
 
756 aa  86.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  38.24 
 
 
518 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
408 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  22.45 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  30.54 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  35.36 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  31.53 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  40.57 
 
 
2796 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
1317 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  26.1 
 
 
1837 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
404 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  44.33 
 
 
361 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  44.33 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  22.98 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  41.03 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  41.03 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  22.64 
 
 
415 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  36.31 
 
 
1059 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  38.68 
 
 
305 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 
414 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  22.98 
 
 
406 aa  79.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  42.27 
 
 
361 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  40 
 
 
1632 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  34.57 
 
 
1035 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>