17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3952 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3952  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0808936  normal  0.0841425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3616  hypothetical protein  78.08 
 
 
291 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524336  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3758  hypothetical protein  35.29 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0144  hypothetical protein  36.95 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2907  hypothetical protein  40 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2627  hypothetical protein  36.68 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3162  hypothetical protein  31.16 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0469333  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2934  hypothetical protein  30.7 
 
 
302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1382  hypothetical protein  33.81 
 
 
272 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.616319  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1016  hypothetical protein  33.66 
 
 
339 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358771 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1313  hypothetical protein  34.27 
 
 
289 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000615424 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2945  hypothetical protein  37.8 
 
 
325 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2037  hypothetical protein  31.53 
 
 
306 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2063  hypothetical protein  31.19 
 
 
306 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4594  hypothetical protein  40.12 
 
 
396 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12781  hypothetical protein  32.11 
 
 
326 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.3952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2191  hypothetical protein  29.07 
 
 
236 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000770677  hitchhiker  0.000224461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>