More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3895 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 240 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  85.06 
 
 		 241 aa  417  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  76.17 
 
 		 239 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  78.67 
 
 		 239 aa  362  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  76.29 
 
 		 240 aa  361  4e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  70.42 
 
 		 240 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  72.27 
 
 		 231 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  64.34 
 
 		 234 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  69.55 
 
 		 236 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  66.67 
 
 		 234 aa  297  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1567  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  65.7 
 
 		 234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  68.04 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  60.24 
 
 		 239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  61.97 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4875  cytochrome c oxidase subunit III  65.8 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal  0.156188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3798  cytochrome c oxidase subunit III  65.8 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  61.11 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  57.87 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  46.43 
 
 		 224 aa  172  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5675  cytochrome c oxidase subunit III  40.08 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  38.26 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  40.51 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3466  cytochrome c oxidase subunit III  41.67 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0380593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  43.84 
 
 		 208 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  36.74 
 
 		 832 aa  115  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  38.16 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  34.45 
 
 		 208 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  35.55 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  39.23 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  33.5 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  29.88 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  30.47 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  32.57 
 
 		 819 aa  98.2  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  33.17 
 
 		 224 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  32.55 
 
 		 825 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  34.63 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.49 
 
 		 211 aa  95.9  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1742  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  32.65 
 
 		 215 aa  95.5  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  34.36 
 
 		 206 aa  95.1  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  33.82 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  32.08 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  31.86 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  32.11 
 
 		 827 aa  93.6  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  28.78 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  28.29 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  28.29 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6214  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.1 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397474  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  32.99 
 
 		 198 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.12 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  39.86 
 
 		 200 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.09 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  31.74 
 
 		 297 aa  92.8  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.46 
 
 		 215 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  28.7 
 
 		 206 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0897  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.14 
 
 		 204 aa  92.4  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.021824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  32.67 
 
 		 204 aa  91.7  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3151  cytochrome c oxidase, subunit III  36.14 
 
 		 270 aa  90.9  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0352  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.12 
 
 		 204 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  28.7 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  34.72 
 
 		 283 aa  90.5  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.14 
 
 		 204 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  36.31 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0240  cytochrome c oxidase, subunit III  31.12 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1141  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  30.85 
 
 		 201 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1118  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  30.85 
 
 		 201 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.14 
 
 		 204 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  36.69 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7137  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.61 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  36.31 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2884  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.83 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  36.69 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  30.93 
 
 		 743 aa  90.1  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.61 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00381  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.12 
 
 		 204 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00313759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3179  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.12 
 
 		 204 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000613684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  36.69 
 
 		 295 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4071  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.95 
 
 		 209 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.953748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3203  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.12 
 
 		 204 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.350739  hitchhiker  0.0000785376 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0465  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.12 
 
 		 204 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0514  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.12 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0470  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.12 
 
 		 204 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0234669  normal  0.574469 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0505  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.12 
 
 		 204 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00786861  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00385  hypothetical protein  31.12 
 
 		 204 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00541093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47180  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.95 
 
 		 209 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  30.54 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  31.98 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  32.17 
 
 		 214 aa  89.4  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.61 
 
 		 215 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0644  quinol oxidase, subunit III  30.85 
 
 		 201 aa  89  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.244808  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4370  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.1 
 
 		 210 aa  89  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  28.63 
 
 		 200 aa  89  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5610  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.35 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1733  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.59 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  34.01 
 
 		 211 aa  88.6  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  31.12 
 
 		 209 aa  88.6  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0597  cytochrome c oxidase, subunit III  28.14 
 
 		 209 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.788928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  34.5 
 
 		 962 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  34.5 
 
 		 974 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  33 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0956  cytochrome c oxidase, subunit III  31.56 
 
 		 205 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>