More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3838 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  100 
 
 		 411 aa  835    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  95.13 
 
 		 411 aa  797    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  61.29 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  58.05 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  52.33 
 
 		 411 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  51.86 
 
 		 412 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  49.75 
 
 		 416 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  47.55 
 
 		 411 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  47.69 
 
 		 419 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  47.71 
 
 		 419 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  48.18 
 
 		 413 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  47.79 
 
 		 413 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  47.79 
 
 		 413 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  49.48 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  49.39 
 
 		 405 aa  356  5e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  47.17 
 
 		 420 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  46.15 
 
 		 415 aa  345  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  47.29 
 
 		 425 aa  334  2e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  48.1 
 
 		 405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  43.84 
 
 		 408 aa  315  8e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  45.66 
 
 		 461 aa  302  7.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  41.79 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  45.53 
 
 		 403 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  42.07 
 
 		 413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  43.38 
 
 		 409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  41.83 
 
 		 417 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  40.94 
 
 		 418 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  39.76 
 
 		 445 aa  276  3e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  43 
 
 		 391 aa  277  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  36.56 
 
 		 412 aa  259  8e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  37.2 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  37.72 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  40.29 
 
 		 425 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  38.97 
 
 		 407 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  35.61 
 
 		 428 aa  229  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  34.62 
 
 		 419 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  34.38 
 
 		 451 aa  222  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  33.73 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  33.25 
 
 		 420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  37.4 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  33.81 
 
 		 461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  34.74 
 
 		 440 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  34.53 
 
 		 456 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  33.73 
 
 		 486 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  32.95 
 
 		 433 aa  203  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  34.43 
 
 		 434 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  34.92 
 
 		 447 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  34.44 
 
 		 426 aa  200  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  34.44 
 
 		 429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  32.14 
 
 		 445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  32.06 
 
 		 478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  32.95 
 
 		 459 aa  192  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  34.03 
 
 		 490 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  32.37 
 
 		 482 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  35.59 
 
 		 430 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  32.24 
 
 		 447 aa  182  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  32.81 
 
 		 447 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  32.84 
 
 		 440 aa  179  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  31.29 
 
 		 407 aa  177  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  34.6 
 
 		 405 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  31.81 
 
 		 445 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  33.5 
 
 		 441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  32.36 
 
 		 431 aa  169  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  30.58 
 
 		 426 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  31.27 
 
 		 421 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  30.96 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  29.59 
 
 		 413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  33.57 
 
 		 409 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  33.57 
 
 		 409 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  33.57 
 
 		 409 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  28.74 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  31.68 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  31.18 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  32.66 
 
 		 407 aa  160  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  32.21 
 
 		 426 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  30.22 
 
 		 400 aa  159  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  30.67 
 
 		 407 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  31.4 
 
 		 421 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  32.45 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  32.04 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  29.95 
 
 		 444 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  31.35 
 
 		 419 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.31 
 
 		 426 aa  156  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  31.95 
 
 		 438 aa  155  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  29.9 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  30.67 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  27.74 
 
 		 444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.82 
 
 		 430 aa  152  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  29.38 
 
 		 423 aa  150  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  31.82 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  31.49 
 
 		 459 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  32.29 
 
 		 423 aa  144  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  31.89 
 
 		 433 aa  143  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  29.31 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  29.76 
 
 		 470 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  30.02 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  32.3 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  28.23 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  28.85 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  28.92 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>