More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3754 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  100 
 
 
407 aa  791    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  58.7 
 
 
401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  53.33 
 
 
389 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  57.85 
 
 
396 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  53.33 
 
 
389 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  61.46 
 
 
413 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  56.73 
 
 
398 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  57.7 
 
 
402 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  56.4 
 
 
402 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  51.49 
 
 
406 aa  345  6e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  47.68 
 
 
393 aa  344  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  51.82 
 
 
447 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  56.23 
 
 
408 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  45.57 
 
 
405 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  45.57 
 
 
405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  46.84 
 
 
398 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  45.53 
 
 
405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  46.65 
 
 
398 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  45.26 
 
 
405 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  45.26 
 
 
405 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  45.65 
 
 
405 aa  298  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  45.14 
 
 
404 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  45.85 
 
 
395 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  41.53 
 
 
406 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  41.53 
 
 
406 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  41.62 
 
 
403 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  41.51 
 
 
392 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  46.52 
 
 
400 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  47.12 
 
 
400 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  44.74 
 
 
404 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  46.85 
 
 
400 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  49.38 
 
 
401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  47.25 
 
 
399 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  47.81 
 
 
399 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  48.03 
 
 
399 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  45.13 
 
 
405 aa  269  7e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  50 
 
 
402 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 
388 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  42.32 
 
 
416 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  48.21 
 
 
399 aa  262  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  45.06 
 
 
400 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  49.87 
 
 
409 aa  252  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  37.88 
 
 
399 aa  251  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  37.63 
 
 
399 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  37.63 
 
 
399 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  40.84 
 
 
411 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  38.5 
 
 
399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  36.71 
 
 
399 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  36.71 
 
 
399 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  38.18 
 
 
385 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  38.56 
 
 
406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  37.08 
 
 
399 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 
406 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  37.56 
 
 
403 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  42.09 
 
 
422 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 
403 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  36.6 
 
 
395 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  39.54 
 
 
405 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  40.56 
 
 
397 aa  222  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  33.33 
 
 
394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  38.3 
 
 
394 aa  219  6e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 
413 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  39.68 
 
 
394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  39.84 
 
 
415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  39.68 
 
 
394 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  39.68 
 
 
394 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  35.25 
 
 
401 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 
399 aa  216  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  39.68 
 
 
394 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  39.79 
 
 
400 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 
413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  37.5 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  39.52 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  37.06 
 
 
394 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 
399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  36.8 
 
 
394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  37.06 
 
 
394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  37.06 
 
 
394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  37.06 
 
 
394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  40.56 
 
 
399 aa  212  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  40.25 
 
 
421 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  38.21 
 
 
401 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  37.37 
 
 
407 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  38.42 
 
 
404 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 
399 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  42.33 
 
 
427 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  36.8 
 
 
394 aa  209  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  39.79 
 
 
399 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  36.34 
 
 
399 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  40.1 
 
 
433 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  39.55 
 
 
389 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  41.06 
 
 
431 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 
415 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  36.6 
 
 
426 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 
389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  37.22 
 
 
391 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  36.6 
 
 
405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 
419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  36.6 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  36.6 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>