78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3713 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3713  PUCC protein  100 
 
 
448 aa  830    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368833  hitchhiker  0.000507532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5366  PUCC protein  70.63 
 
 
455 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.238327  normal  0.20788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4821  PUCC protein  71.26 
 
 
459 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1853  PUCC protein  69.12 
 
 
512 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5288  PUCC protein  71.19 
 
 
458 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212977  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1720  PUCC protein  58.01 
 
 
438 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3991  light harvesting pigment MFS transporter Bch2  59.18 
 
 
447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  normal  0.25213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3746  PUCC protein  59.81 
 
 
447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00047851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1303  PUCC protein  56.79 
 
 
452 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0628  PUCC protein  56.29 
 
 
449 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319243  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6423  light harvesting pigment major facilitator family (MFS) transporter, Bch2-like protein  56.22 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3529  PUCC protein  56.37 
 
 
433 aa  398  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.513682 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2062  PUCC protein  56.66 
 
 
455 aa  393  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.035842 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1601  PUCC protein  56.18 
 
 
447 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1921  PUCC protein  53.92 
 
 
427 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.824161 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0278  putative light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC  54.37 
 
 
427 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1017  PUCC protein  52.61 
 
 
427 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0166  PUCC protein  44.6 
 
 
417 aa  239  9e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2893  PUCC protein  31.09 
 
 
474 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00562586  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3165  PUCC protein  30.48 
 
 
474 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360392  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1903  PUCC protein  31.54 
 
 
433 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1022  PUCC protein  32.68 
 
 
434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2807  PUCC protein  30.37 
 
 
472 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1543  PUCC protein  32.21 
 
 
433 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000848404 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0618  PUCC protein  33.59 
 
 
480 aa  137  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3432  PUCC protein  31.46 
 
 
434 aa  136  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0654139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0979  PUCC protein  33.26 
 
 
459 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0518  PUCC protein  32.09 
 
 
449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1912  PUCC protein  30.26 
 
 
457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.199112  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1287  PUCC protein  30.97 
 
 
432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1668  PUCC protein  27.11 
 
 
448 aa  127  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3539  PUCC protein  31.32 
 
 
481 aa  126  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1960  PUCC protein  33.08 
 
 
459 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.77527  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0315  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  33.08 
 
 
459 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1534  PUCC protein  29.46 
 
 
457 aa  123  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00123663  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1461  PucC protein  28.29 
 
 
449 aa  123  8e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833113  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1762  hypothetical protein  31.33 
 
 
483 aa  121  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1933  PUCC protein  32.75 
 
 
479 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0689  PucC protein  29.06 
 
 
448 aa  120  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.85813  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1560  PUCC protein  27.95 
 
 
450 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  hitchhiker  0.000951091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0355  PUCC protein  30.33 
 
 
488 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1318  PUCC protein  34.18 
 
 
477 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  0.172961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6412  photosynthetic complex (LH1) assembly protein LhaA  32.66 
 
 
477 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0290  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  32.4 
 
 
479 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1583  PUCC protein  31.7 
 
 
465 aa  117  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652092  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0658  PUCC protein  28.54 
 
 
472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.573961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3787  PUCC protein  30.51 
 
 
483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4031  PucC protein, chlorophyll MFS exporter  31.66 
 
 
473 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.344544  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3332  PUCC protein  28.6 
 
 
481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4446  PucC chlorophyll MFS exporter  31.66 
 
 
473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0028  PUCC protein  28.93 
 
 
477 aa  113  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.30591  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3785  PUCC protein  31.3 
 
 
475 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2898  pucC  30.43 
 
 
467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0911  PUCC protein  29.68 
 
 
449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.592939  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2398  PUCC protein  31.3 
 
 
475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.6432  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1735  PUCC protein  33.56 
 
 
477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1849  PUCC protein  27.88 
 
 
448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4811  PUCC protein  34.39 
 
 
481 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0459  PUCC protein  27.63 
 
 
478 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.222585  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5356  PUCC protein  34.39 
 
 
481 aa  110  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1680  PUCC protein  29.41 
 
 
478 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1632  PUCC protein  30.07 
 
 
475 aa  109  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3083  chlorophyll major facilitator superfamily (MFS) exporter PucC  31.64 
 
 
475 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0156  PUCC protein  31.25 
 
 
478 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1240  PUCC protein  31.65 
 
 
484 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000359132  unclonable  0.0000000283623 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0990  PUCC protein  27.88 
 
 
452 aa  107  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5278  PUCC protein  34.69 
 
 
481 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3731  PUCC protein  32.65 
 
 
477 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.532821  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2037  PUCC protein  32.23 
 
 
476 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3976  LhaA protein  32.65 
 
 
477 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1005  PUCC protein  30.46 
 
 
479 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1689  PUCC protein  26.91 
 
 
487 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1707  PUCC protein  26.91 
 
 
487 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3723  PUCC protein  32.39 
 
 
476 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0690908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3131  PUCC protein  26.24 
 
 
452 aa  96.7  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400987  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03411  Na+/melibiose symporter  27.78 
 
 
472 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1843  PUCC protein  33.58 
 
 
475 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.085296 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1652  light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC-like  26.81 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>