70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3668 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4519  domain of unknown function DUF1745  88.98 
 
 
387 aa  654  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3668  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  764  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432885  hitchhiker  0.00253652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  69.33 
 
 
378 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  68.59 
 
 
386 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  70.94 
 
 
402 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  63.66 
 
 
398 aa  466  1e-130  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  63.66 
 
 
398 aa  464  1e-130  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  62.2 
 
 
389 aa  458  1e-128  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  62.04 
 
 
400 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  40.23 
 
 
386 aa  259  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  42.5 
 
 
392 aa  255  9e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  41.02 
 
 
380 aa  254  2e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  36.9 
 
 
382 aa  249  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  39.89 
 
 
387 aa  246  7e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  39.63 
 
 
387 aa  245  1e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  35.16 
 
 
382 aa  244  2e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3320  hypothetical protein  42.25 
 
 
387 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  39.1 
 
 
384 aa  243  4e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  39.62 
 
 
387 aa  240  3e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  41.16 
 
 
392 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  41.16 
 
 
392 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  41.16 
 
 
392 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  41.16 
 
 
392 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  41.16 
 
 
384 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  38.48 
 
 
399 aa  239  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  40.41 
 
 
390 aa  239  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  40.86 
 
 
386 aa  238  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  40.88 
 
 
392 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  40.41 
 
 
390 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  40.88 
 
 
384 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38990  hypothetical protein  42.77 
 
 
387 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.880326  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  36.62 
 
 
381 aa  235  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  36.1 
 
 
374 aa  233  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  35.13 
 
 
382 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  36.59 
 
 
383 aa  222  7e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  38.78 
 
 
386 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  38.78 
 
 
386 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  34.81 
 
 
385 aa  209  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  35.36 
 
 
389 aa  209  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  38.66 
 
 
385 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  34.92 
 
 
379 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2353  hypothetical protein  36.93 
 
 
393 aa  200  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  33.69 
 
 
378 aa  190  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  30.08 
 
 
460 aa  166  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  30.49 
 
 
447 aa  164  2e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  30.54 
 
 
371 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  30.73 
 
 
368 aa  152  9e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  28.95 
 
 
464 aa  141  2e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5004  chemotaxis sensory transducer  30.16 
 
 
672 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.71371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.68 
 
 
675 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0690  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
1186 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.7 
 
 
647 aa  86.3  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223967  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.33 
 
 
669 aa  79.7  7e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  27.98 
 
 
387 aa  80.1  7e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  26.56 
 
 
666 aa  72.4  1e-11  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1866  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.13 
 
 
650 aa  71.2  3e-11  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  28.28 
 
 
427 aa  68.2  3e-10  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  25.22 
 
 
381 aa  63.9  4e-09  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  26.58 
 
 
408 aa  63.5  5e-09  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003465  hypothetical protein  23.08 
 
 
393 aa  63.2  7e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  21.72 
 
 
405 aa  54.3  3e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  27.9 
 
 
379 aa  47.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  20.26 
 
 
394 aa  47.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  21.61 
 
 
383 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  20.59 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  20.77 
 
 
934 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  24.57 
 
 
1101 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  26.16 
 
 
373 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  23.33 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  8.47515e-09 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  24.78 
 
 
387 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>