43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3621 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  781    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  72.27 
 
 		 408 aa  559  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  72.27 
 
 		 408 aa  557  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  72.83 
 
 		 408 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  72.33 
 
 		 411 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  50.27 
 
 		 386 aa  339  5e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  49.44 
 
 		 420 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  48.99 
 
 		 367 aa  316  5e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  48.9 
 
 		 391 aa  315  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  48.29 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  45.25 
 
 		 427 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  47.89 
 
 		 424 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  45.25 
 
 		 429 aa  299  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  44.97 
 
 		 422 aa  298  9e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  49.57 
 
 		 397 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  42.42 
 
 		 400 aa  292  8e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  47.98 
 
 		 392 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  44.94 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  42.74 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  43.04 
 
 		 393 aa  275  8e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  41.05 
 
 		 395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  46.05 
 
 		 369 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  43.65 
 
 		 394 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  41.62 
 
 		 410 aa  262  8e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  37.28 
 
 		 400 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  38.26 
 
 		 408 aa  257  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  41.19 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  36.69 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  40.48 
 
 		 412 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  39.34 
 
 		 416 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  41 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  39.88 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  40.81 
 
 		 402 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  43.36 
 
 		 393 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  38.64 
 
 		 391 aa  177  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  24.91 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  25.66 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  21.17 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  21.47 
 
 		 432 aa  50.1  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  22.96 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2578  extracellular ligand-binding receptor  22.45 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436298  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  22.67 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>