72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3617 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  754    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4519  domain of unknown function DUF1745  68.44 
 
 
387 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3668  hypothetical protein  69.33 
 
 
385 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432885  hitchhiker  0.00253652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  64.8 
 
 
386 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  62.27 
 
 
398 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  62.27 
 
 
398 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  61.74 
 
 
389 aa  454  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  66.22 
 
 
402 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  62.5 
 
 
400 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  40.9 
 
 
387 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  40.36 
 
 
380 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  40.9 
 
 
387 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  37.84 
 
 
382 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  40.11 
 
 
387 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  42.98 
 
 
392 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  39.2 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  39.58 
 
 
386 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  42.18 
 
 
390 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  42.18 
 
 
390 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  35.48 
 
 
382 aa  246  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  42.82 
 
 
386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38990  hypothetical protein  41.6 
 
 
387 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.880326  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  35.95 
 
 
381 aa  240  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3320  hypothetical protein  41.27 
 
 
387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  33.96 
 
 
382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  40.93 
 
 
392 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  40.93 
 
 
392 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  40.93 
 
 
392 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  40.93 
 
 
392 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  40.93 
 
 
392 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  40.93 
 
 
384 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  40.93 
 
 
384 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  38.24 
 
 
399 aa  230  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  35.85 
 
 
374 aa  230  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  37.8 
 
 
386 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  37.53 
 
 
386 aa  222  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  34.68 
 
 
383 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  33.42 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  34.57 
 
 
379 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  38.85 
 
 
385 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  35.98 
 
 
389 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  34.05 
 
 
378 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  33.51 
 
 
371 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2353  hypothetical protein  35.28 
 
 
393 aa  180  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  30.97 
 
 
460 aa  167  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  29.69 
 
 
447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  29.79 
 
 
368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  27.61 
 
 
464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5004  chemotaxis sensory transducer  28.53 
 
 
672 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.71371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.76 
 
 
647 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.07 
 
 
675 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  27.33 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.42 
 
 
669 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003465  hypothetical protein  23.28 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  22.95 
 
 
512 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1866  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.14 
 
 
650 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0690  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
1186 aa  73.6  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  25.77 
 
 
666 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  24.73 
 
 
427 aa  64.7  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  25.87 
 
 
408 aa  63.5  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  23.1 
 
 
395 aa  62.8  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  22.83 
 
 
405 aa  57  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  19.26 
 
 
934 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  24.93 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  18.96 
 
 
932 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  24.7 
 
 
373 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  24.61 
 
 
401 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  27.22 
 
 
395 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  18.59 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  22.16 
 
 
383 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  22.35 
 
 
416 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2542  hypothetical protein  22.17 
 
 
395 aa  43.1  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>