More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3583 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
106 aa  216  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  84.91 
 
 
106 aa  187  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  62.26 
 
 
106 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  63.21 
 
 
106 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  62.26 
 
 
106 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60.38 
 
 
106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0483  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.49 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4453  HesB/YadR/YfhF  55.66 
 
 
106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  57.14 
 
 
107 aa  123  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3622  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.24 
 
 
106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246464 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.38 
 
 
106 aa  110  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  51.43 
 
 
106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.43 
 
 
106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  48.57 
 
 
110 aa  107  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.52 
 
 
106 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 
127 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 
127 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  43.81 
 
 
127 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.57 
 
 
122 aa  100  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.57 
 
 
122 aa  100  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  46.67 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
127 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  42.86 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  45.28 
 
 
206 aa  94  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.1 
 
 
116 aa  94  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1581  HesB/YadR/YfhF  45.19 
 
 
186 aa  90.9  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617469  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  40.38 
 
 
113 aa  90.5  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3146  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
120 aa  90.5  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
109 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  43.52 
 
 
123 aa  90.1  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.2 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4146  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
118 aa  89.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  decreased coverage  0.00532589 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3121  HesB/YadR/YfhF  43.27 
 
 
120 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4803  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
121 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2053  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
112 aa  88.6  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.432369  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
206 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2134  hypothetical protein  45.19 
 
 
112 aa  88.6  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.191156  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3261  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
122 aa  88.6  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.347724  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1011  HesB/YadR/YfhF  41.35 
 
 
116 aa  87.8  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.752752  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0149  HesB/YadR/YfhF-family protein  45.1 
 
 
106 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0954  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
133 aa  87.8  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.557942  normal  0.360876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1797  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
120 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.654159  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1664  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
121 aa  87.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.138511 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1285  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
117 aa  87  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.257084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1955  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000220764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4144  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.5 
 
 
116 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0915367  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2494  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.68 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.686511  normal  0.176727 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10610  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.213974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4257  HesB/YadR/YfhF  39.81 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.38 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00747  HesB protein family  46.15 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.521174  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14110  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1456  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0753774  normal  0.435352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2218  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0238312  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3357  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.05 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.1 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.22 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2733  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.19 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12230  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
130 aa  84.7  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.40084  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1095  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00345667  decreased coverage  0.0031611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1203  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.592429  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.2 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
117 aa  84  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0985  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
116 aa  84  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2109  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.61 
 
 
124 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  39.62 
 
 
113 aa  83.6  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12232  hypothetical protein  44.23 
 
 
118 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000227512  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
105 aa  83.6  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3302  HesB/YadR/YfhF  45.19 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3313  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3364  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0837233 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.46 
 
 
121 aa  83.6  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1017  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2279  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.05 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000652366  hitchhiker  0.00000000102221 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1530  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
117 aa  83.2  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15600  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.38 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.722466  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01609  HesB protein family  38.46 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2591  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0605  HesB/YadR/YfhF family protein  38.46 
 
 
116 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.38 
 
 
119 aa  82  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.324909  hitchhiker  0.0039414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2084  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.38 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3536  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.42 
 
 
120 aa  82  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0677815  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4568  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.46 
 
 
116 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420029  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1364  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  40 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2665  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.22 
 
 
117 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840353  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3154  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.38 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.889922  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3125  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185787  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  38.24 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.68 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1343  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.39 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.388172  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0751  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.42 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118128  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2945  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648608  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3349  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3568  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0534346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>