More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3499 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  100 
 
 
265 aa  526  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  67.43 
 
 
268 aa  341  7e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  51.82 
 
 
251 aa  254  7e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  49.79 
 
 
254 aa  254  8e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  52.21 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  49.37 
 
 
254 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  45.85 
 
 
254 aa  249  4e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  50.64 
 
 
254 aa  248  6e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  45.34 
 
 
257 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  53.3 
 
 
267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  51.91 
 
 
259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  49.38 
 
 
265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  49.2 
 
 
259 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.39 
 
 
253 aa  241  9e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  54.03 
 
 
253 aa  241  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  50.38 
 
 
272 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  52.44 
 
 
259 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  50 
 
 
259 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.25 
 
 
258 aa  240  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  51.26 
 
 
264 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  53.19 
 
 
271 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  47.15 
 
 
252 aa  239  4e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  48.8 
 
 
259 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  47.88 
 
 
252 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  49.36 
 
 
297 aa  237  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  48.64 
 
 
289 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  49.79 
 
 
263 aa  236  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  51.11 
 
 
259 aa  236  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  51.11 
 
 
259 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.59 
 
 
278 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  51.79 
 
 
278 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50.4 
 
 
264 aa  234  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  52.14 
 
 
271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.19 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  46.96 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  47.1 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.27 
 
 
280 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  50.88 
 
 
253 aa  233  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  54.46 
 
 
288 aa  232  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  52.14 
 
 
271 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  49.4 
 
 
287 aa  232  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  51.28 
 
 
267 aa  231  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  50.45 
 
 
258 aa  231  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 
260 aa  231  9e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  48 
 
 
273 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  48.76 
 
 
263 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  49.78 
 
 
260 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  50 
 
 
260 aa  229  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
264 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  47.84 
 
 
273 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50 
 
 
267 aa  229  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  52.25 
 
 
269 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  45.98 
 
 
261 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  51.45 
 
 
264 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  46.91 
 
 
263 aa  229  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.44 
 
 
283 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  46.75 
 
 
308 aa  228  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  49.2 
 
 
257 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  48.33 
 
 
282 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  47.62 
 
 
293 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  47.62 
 
 
293 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  45.66 
 
 
292 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  49.78 
 
 
256 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 
261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  48.59 
 
 
284 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  50.22 
 
 
278 aa  225  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  44.15 
 
 
271 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  47.43 
 
 
259 aa  225  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  52.89 
 
 
285 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  47.64 
 
 
272 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  48.83 
 
 
276 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  52.91 
 
 
245 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  46.32 
 
 
279 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  47.64 
 
 
272 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  47.18 
 
 
269 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  47.64 
 
 
272 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  43.7 
 
 
258 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  46.88 
 
 
301 aa  223  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  48 
 
 
265 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
260 aa  222  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  50.24 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  47.33 
 
 
255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  51.11 
 
 
260 aa  221  7e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  44.4 
 
 
306 aa  221  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.33 
 
 
260 aa  221  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  48.8 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.36 
 
 
275 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  46.9 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.8 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  46.33 
 
 
267 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  47.22 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  43.39 
 
 
261 aa  220  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  45.83 
 
 
315 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  47.22 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  46.83 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  47.35 
 
 
307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  46.28 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  47.01 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  47.39 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>