196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3487 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 
848 aa  1477    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  56.58 
 
 
1219 aa  300  9e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  49.59 
 
 
842 aa  300  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  54.86 
 
 
1168 aa  294  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  55.64 
 
 
936 aa  293  6e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  53.35 
 
 
815 aa  294  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  56.87 
 
 
1055 aa  293  7e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  55.62 
 
 
748 aa  293  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  66.32 
 
 
743 aa  286  9e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  55.66 
 
 
1147 aa  280  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  58.06 
 
 
1580 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  34.32 
 
 
1408 aa  263  1e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  49.91 
 
 
1451 aa  251  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  51.7 
 
 
706 aa  241  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  55.01 
 
 
813 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  58.04 
 
 
712 aa  233  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  44.55 
 
 
1170 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  42.86 
 
 
1297 aa  228  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  40.04 
 
 
835 aa  227  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  38.42 
 
 
835 aa  219  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  40.81 
 
 
835 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  65.62 
 
 
459 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  59 
 
 
462 aa  214  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  50.61 
 
 
512 aa  213  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  40.21 
 
 
1321 aa  212  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  40.38 
 
 
951 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  41.96 
 
 
934 aa  202  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  41.21 
 
 
838 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  55.56 
 
 
643 aa  197  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  53.23 
 
 
493 aa  185  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  41.97 
 
 
2914 aa  179  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  48.92 
 
 
499 aa  178  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  46.06 
 
 
867 aa  177  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  39.58 
 
 
835 aa  174  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  34.63 
 
 
1873 aa  172  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  44.66 
 
 
641 aa  167  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  53.48 
 
 
639 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  53.04 
 
 
585 aa  165  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  47.92 
 
 
465 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  47.67 
 
 
594 aa  160  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  52.38 
 
 
516 aa  160  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  47.25 
 
 
308 aa  157  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  61.86 
 
 
606 aa  154  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  46.74 
 
 
460 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  37.5 
 
 
342 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  47.37 
 
 
343 aa  148  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  45.11 
 
 
1050 aa  147  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  43 
 
 
738 aa  145  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  46.03 
 
 
346 aa  145  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  43.13 
 
 
469 aa  145  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  54.13 
 
 
524 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  44.39 
 
 
346 aa  142  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  47.47 
 
 
452 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  55.09 
 
 
300 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  42.13 
 
 
465 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  47.43 
 
 
647 aa  134  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  45.26 
 
 
447 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  38.91 
 
 
1503 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  55.6 
 
 
426 aa  127  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  46.79 
 
 
418 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  47.4 
 
 
363 aa  122  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  38.46 
 
 
542 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  59.15 
 
 
348 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  50.24 
 
 
481 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  50.24 
 
 
478 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  31.77 
 
 
644 aa  114  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  41.05 
 
 
283 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  40.09 
 
 
322 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  38.71 
 
 
319 aa  111  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  38.74 
 
 
442 aa  110  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  52.22 
 
 
469 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  37.86 
 
 
792 aa  108  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  43.78 
 
 
587 aa  107  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  55.66 
 
 
326 aa  106  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  45.27 
 
 
492 aa  106  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  42.62 
 
 
582 aa  105  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  38.89 
 
 
645 aa  104  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  53.09 
 
 
252 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  43.69 
 
 
466 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  40.51 
 
 
444 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  61.15 
 
 
380 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  31.65 
 
 
767 aa  102  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  44.09 
 
 
468 aa  100  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  38.73 
 
 
833 aa  100  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  36.27 
 
 
589 aa  99  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  38.46 
 
 
1462 aa  98.2  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  38.97 
 
 
298 aa  97.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  64.41 
 
 
347 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  64.41 
 
 
347 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  38.41 
 
 
403 aa  95.5  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  46.01 
 
 
493 aa  92.8  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  44.78 
 
 
582 aa  91.7  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  57.37 
 
 
474 aa  90.5  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  38.55 
 
 
273 aa  90.5  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  31.24 
 
 
648 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  58.04 
 
 
274 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  37.93 
 
 
561 aa  86.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  40.79 
 
 
232 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  47.46 
 
 
473 aa  85.5  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  39.77 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>