More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3468 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  527  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  77.19 
 
 		 263 aa  437  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  74.05 
 
 		 263 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  75.71 
 
 		 268 aa  394  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  65.52 
 
 		 263 aa  359  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  67.72 
 
 		 263 aa  348  5e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  66.54 
 
 		 262 aa  347  9e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  69.75 
 
 		 261 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  67.45 
 
 		 257 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  65.35 
 
 		 262 aa  332  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2108  hypothetical protein  51.4 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  46.81 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3213  hypothetical protein  46.73 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1371  hypothetical protein  47.66 
 
 		 242 aa  192  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6293  predicted protein  47.96 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000494252 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1036  hypothetical protein  49.05 
 
 		 246 aa  188  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3692  hypothetical protein  46.64 
 
 		 227 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3023  hypothetical protein  44.49 
 
 		 249 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0534  hypothetical protein  42.62 
 
 		 249 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1369  class II aldolase/adducin family protein  38.4 
 
 		 247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  40.32 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  40.87 
 
 		 282 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  39.92 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  40.59 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2461  hypothetical protein  41.18 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  40.32 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  41.49 
 
 		 263 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  36.91 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  35.92 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  37.05 
 
 		 258 aa  148  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  36.33 
 
 		 257 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  36.33 
 
 		 257 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  35.63 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  35.92 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  37.14 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  37.13 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  36.51 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  35.92 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  38.24 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  35.48 
 
 		 281 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  36.33 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  37.2 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  40.27 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  35.77 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  37.24 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  35.51 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  40.69 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  36.25 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  37.04 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  36.58 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  36.44 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2007  hypothetical protein  37.61 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  36.29 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  39.11 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  32.3 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  39.27 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  39.27 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  34.55 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  34.76 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  35.29 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  36.09 
 
 		 263 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  34.14 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  33.88 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  38.87 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  35.37 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  38.6 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0024  aldolase II superfamily protein  35.92 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178448  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2494  aldolase II superfamily protein  35.92 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2213  aldolase II superfamily protein  35.92 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2870  aldolase II superfamily protein  35.92 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0638  aldolase II superfamily protein  35.92 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0803  aldolase II superfamily protein  35.92 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  36.71 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0623  aldolase II superfamily protein  35.92 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  33.47 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  33.73 
 
 		 262 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  35.86 
 
 		 257 aa  135  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  35.1 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0279  hypothetical protein  38.43 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.400085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0438  hypothetical protein  36.21 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  38.58 
 
 		 271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  35.5 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  35.91 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0806  aldolase II superfamily protein  38.87 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.666611  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  33.61 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  33.19 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  35.43 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  31.58 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0752  aldolase II superfamily protein  37.65 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.322405 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  38.54 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  38.54 
 
 		 322 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  38.35 
 
 		 250 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  32.68 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  38.73 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  35.95 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  37.61 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  35.12 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  33.2 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  33.33 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5620  aldolase II superfamily protein  39.68 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>