More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3356 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 211 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.94 
 
 		 215 aa  187  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.04 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.08 
 
 		 216 aa  171  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.94 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  39.81 
 
 		 240 aa  142  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.34 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.81 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.62 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.34 
 
 		 241 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.57 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  41.51 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.41 
 
 		 226 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.41 
 
 		 226 aa  137  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.54 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  36.49 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.32 
 
 		 234 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  37.32 
 
 		 309 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.01 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.43 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.65 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.48 
 
 		 229 aa  104  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.48 
 
 		 229 aa  104  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  32.06 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.29 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.32 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.82 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.47 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  34.11 
 
 		 249 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  33.94 
 
 		 267 aa  95.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  35.24 
 
 		 203 aa  94.7  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  33.8 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.95 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.88 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  33.33 
 
 		 250 aa  88.2  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  31.92 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  31.44 
 
 		 211 aa  85.9  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  29.91 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.18 
 
 		 240 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.56 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  30.14 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1008  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.7 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.73 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  31.28 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.7 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.49 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  32.56 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.7 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.23 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.23 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.23 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.23 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.26 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685518 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.75 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  24.89 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.67 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.48 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  29.19 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  28.85 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.65 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.05 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.56 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.36 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.97 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.97 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.33 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.28 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.01 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.19 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.73 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.43 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.43 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.67 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.9 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  31.28 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.29 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0699  ParA family protein  31.28 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  31.28 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1041  ParA family protein  31.28 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2314  ParA family protein  31.28 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0184356  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2973  ParA family protein  31.28 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510642  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.95 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.71 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1202  ParA family protein  32.08 
 
 		 331 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.3 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  35.85 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.28 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  30.81 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.84 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03280  parA family protein  29.85 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.1 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1745  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.7 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.543877  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  32.58 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.09 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.5 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  25.5 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5580  putative plasmid partitioning protein  30.22 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>