More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3258 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 359 aa  676    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  84.59 
 
 		 359 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  78.06 
 
 		 358 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  78.01 
 
 		 358 aa  510  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  77.71 
 
 		 358 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  75.7 
 
 		 358 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  63.35 
 
 		 374 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.17 
 
 		 364 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.33 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.26 
 
 		 364 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.87 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.51 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.34 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.71 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  59.29 
 
 		 348 aa  358  6e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.65 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.65 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.76 
 
 		 364 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  59.16 
 
 		 361 aa  334  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.49 
 
 		 363 aa  332  7.000000000000001e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.62 
 
 		 362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.26 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.41 
 
 		 362 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.07 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.81 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.99 
 
 		 357 aa  316  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.73 
 
 		 349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  50.43 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.25 
 
 		 356 aa  298  8e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.12 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.07 
 
 		 356 aa  293  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.04 
 
 		 352 aa  292  6e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.59 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 348 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.73 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.63 
 
 		 352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.18 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.33 
 
 		 354 aa  278  7e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.33 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.16 
 
 		 362 aa  276  5e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  46.18 
 
 		 349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.33 
 
 		 355 aa  266  4e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.09 
 
 		 357 aa  265  8e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.97 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.95 
 
 		 361 aa  263  3e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.74 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.74 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  48.25 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.06 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1784  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.86 
 
 		 333 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.45 
 
 		 335 aa  260  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.96 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.65 
 
 		 344 aa  259  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  41.46 
 
 		 456 aa  259  6e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.19 
 
 		 349 aa  259  7e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.48 
 
 		 348 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  45.88 
 
 		 357 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.69 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  43.57 
 
 		 336 aa  256  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  43.4 
 
 		 339 aa  255  7e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.96 
 
 		 363 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  48.34 
 
 		 361 aa  252  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.91 
 
 		 351 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  41.91 
 
 		 348 aa  251  2e-65  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 		 350 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  45.01 
 
 		 361 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.91 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  46.18 
 
 		 367 aa  249  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  43.84 
 
 		 346 aa  249  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.5 
 
 		 345 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.35 
 
 		 360 aa  249  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.3 
 
 		 356 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.3 
 
 		 356 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  43.75 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.64 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.07 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.26 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.94 
 
 		 345 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.07 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.14 
 
 		 339 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  43.03 
 
 		 340 aa  245  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.38 
 
 		 364 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.48 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.28 
 
 		 337 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.11 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.38 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.25 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.7 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.86 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2138  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.4 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.06 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0940  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.57 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.365408  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.67 
 
 		 353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.58 
 
 		 344 aa  243  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 351 aa  243  5e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.86 
 
 		 358 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.98 
 
 		 361 aa  242  6e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.2 
 
 		 350 aa  242  6e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.41 
 
 		 360 aa  242  7e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.63 
 
 		 344 aa  242  7.999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>