27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3249 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  710    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  72.19 
 
 
374 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  54.95 
 
 
368 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  54.52 
 
 
366 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  54.14 
 
 
367 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  52.56 
 
 
368 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  34.62 
 
 
354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3536  hypothetical protein  32.94 
 
 
350 aa  137  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0317173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3559  hypothetical protein  31.16 
 
 
343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  30.81 
 
 
397 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  32.74 
 
 
397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  28.8 
 
 
395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  27.47 
 
 
394 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5213  hypothetical protein  31.01 
 
 
397 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0672  hypothetical protein  29.25 
 
 
396 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.745104  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3224  hypothetical protein  30.11 
 
 
336 aa  97.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0581  hypothetical protein  26.78 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  25.66 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0991  hypothetical protein  26.12 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  28.03 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  24.05 
 
 
338 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1585  hypothetical protein  25.77 
 
 
366 aa  60.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.399212 
 
 
-
 
NC_004310  BR1989  hypothetical protein  22.9 
 
 
339 aa  57.4  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1913  hypothetical protein  22.52 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3086  hypothetical protein  25.31 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  24.93 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3260  hypothetical protein  25.17 
 
 
427 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>