More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3189 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  100 
 
 		 320 aa  621  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  89.03 
 
 		 322 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  72.12 
 
 		 365 aa  435  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  72.12 
 
 		 365 aa  434  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  73.08 
 
 		 367 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0928  integrase family protein  71.29 
 
 		 326 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  63.06 
 
 		 323 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  63.32 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  62.1 
 
 		 329 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  61.02 
 
 		 321 aa  371  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  62.54 
 
 		 323 aa  368  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  63.97 
 
 		 300 aa  368  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  61.15 
 
 		 324 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  62.62 
 
 		 342 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  61.22 
 
 		 324 aa  362  6e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1177  integrase family protein  63.14 
 
 		 329 aa  353  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  53.95 
 
 		 311 aa  289  5.0000000000000004e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0942  site-specific tyrosine recombinase XerC  49.21 
 
 		 315 aa  288  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3403  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.42 
 
 		 313 aa  287  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  49.04 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.29 
 
 		 322 aa  285  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  53.16 
 
 		 311 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  49.21 
 
 		 315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.9 
 
 		 315 aa  282  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  52.16 
 
 		 311 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  50.32 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2933  site-specific tyrosine recombinase XerC  50.97 
 
 		 313 aa  271  7e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  49.03 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  48.38 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  49.68 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1222  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.16 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  49.84 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.24 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0259  phage integrase  50.82 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.72 
 
 		 312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2064  phage integrase  49.5 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2215  site-specific tyrosine recombinase XerC  50.83 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0563  site-specific tyrosine recombinase XerC  50.83 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.792208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0222  phage integrase family protein  45.21 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.25 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  35.95 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  35.2 
 
 		 311 aa  205  9e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  35 
 
 		 309 aa  200  3e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.44 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  38.83 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  38.69 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.94 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  41.23 
 
 		 335 aa  186  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  40.86 
 
 		 298 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.82 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  42.12 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.1 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0194  tyrosine recombinase XerC subunit  41.2 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.4 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0082  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.43 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  38.76 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.12 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.33 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.45 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  36.48 
 
 		 300 aa  175  7e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  43.14 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  41.16 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2366  integrase family protein  40.51 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.18523  hitchhiker  0.000000198716 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2746  tyrosine recombinase XerC  40.51 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  39.14 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3433  phage integrase family protein  37.72 
 
 		 345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  40.71 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  43.18 
 
 		 343 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  43.18 
 
 		 343 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3442  phage integrase  40.26 
 
 		 337 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.38 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  37.54 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.61 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  37.06 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  39.93 
 
 		 294 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  42.39 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  35.62 
 
 		 291 aa  169  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3697  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.05 
 
 		 328 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  38.83 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  41.72 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  32.57 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0052  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.87 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.14 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  37.01 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.31 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0057  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.22 
 
 		 369 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326798  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  36.36 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.36 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.36 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.36 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.36 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.26 
 
 		 306 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  33 
 
 		 291 aa  165  9e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.26 
 
 		 306 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.36 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  34.47 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.06 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  33.33 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2016  phage integrase family protein  35.45 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  34.09 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>