More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3178 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  85.97 
 
 		 556 aa  873    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 553 aa  1053    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  67.46 
 
 		 567 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  67.46 
 
 		 567 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  61.8 
 
 		 543 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  66.24 
 
 		 566 aa  579  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  51.67 
 
 		 536 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  52.47 
 
 		 576 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  50.68 
 
 		 541 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  50.94 
 
 		 536 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  50 
 
 		 536 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  49.51 
 
 		 535 aa  444  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  49.91 
 
 		 536 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  51.66 
 
 		 550 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  50.39 
 
 		 540 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  46.89 
 
 		 534 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  45.19 
 
 		 557 aa  392  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  46.41 
 
 		 532 aa  378  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  46.22 
 
 		 532 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  46.35 
 
 		 534 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  45.54 
 
 		 532 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  48 
 
 		 528 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  45.54 
 
 		 534 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  42.28 
 
 		 543 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  34.9 
 
 		 541 aa  318  2e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  40.61 
 
 		 523 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  40.61 
 
 		 523 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  40.25 
 
 		 531 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  38.12 
 
 		 537 aa  266  8.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  38.33 
 
 		 525 aa  250  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  39.33 
 
 		 502 aa  250  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  38.04 
 
 		 528 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  38.93 
 
 		 495 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  38.02 
 
 		 495 aa  217  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  28.85 
 
 		 501 aa  216  9.999999999999999e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  37.86 
 
 		 495 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  28.66 
 
 		 472 aa  202  9.999999999999999e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  29.76 
 
 		 488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  32.49 
 
 		 507 aa  193  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  34.98 
 
 		 508 aa  189  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  38.69 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  33.4 
 
 		 509 aa  189  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  33.21 
 
 		 515 aa  187  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  33.21 
 
 		 515 aa  187  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  33.21 
 
 		 515 aa  187  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  30.34 
 
 		 542 aa  187  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  32.1 
 
 		 516 aa  186  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  34.72 
 
 		 521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  32.55 
 
 		 507 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  36.6 
 
 		 487 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  32.85 
 
 		 532 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  30.81 
 
 		 521 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  31.19 
 
 		 523 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  33.95 
 
 		 503 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  33.15 
 
 		 512 aa  178  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  33.68 
 
 		 503 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  33.15 
 
 		 512 aa  178  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  31.87 
 
 		 509 aa  176  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  31.79 
 
 		 529 aa  177  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  33.01 
 
 		 512 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  31.79 
 
 		 529 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  31.79 
 
 		 529 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  30.87 
 
 		 524 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  31.79 
 
 		 529 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  31.79 
 
 		 529 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  35.56 
 
 		 497 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  32.78 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  30.52 
 
 		 509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  33.54 
 
 		 523 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  33.08 
 
 		 512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  33.2 
 
 		 511 aa  174  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  32.96 
 
 		 512 aa  174  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  31.2 
 
 		 537 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  32.82 
 
 		 512 aa  173  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  30.87 
 
 		 524 aa  171  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  32.56 
 
 		 509 aa  170  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  33.11 
 
 		 506 aa  170  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  33.95 
 
 		 522 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  31.4 
 
 		 525 aa  167  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  32.9 
 
 		 510 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  31.33 
 
 		 515 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  29.91 
 
 		 518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  32.96 
 
 		 502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  29.7 
 
 		 520 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  30.72 
 
 		 522 aa  164  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2726  apolipoprotein N-acyltransferase  32.29 
 
 		 567 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  35.92 
 
 		 588 aa  163  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  31.4 
 
 		 510 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  29.25 
 
 		 512 aa  161  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  29.03 
 
 		 510 aa  161  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  30.68 
 
 		 519 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  30.55 
 
 		 573 aa  160  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6026  apolipoprotein N-acyltransferase  31.16 
 
 		 562 aa  160  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  29.85 
 
 		 516 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  29.61 
 
 		 529 aa  159  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  27.87 
 
 		 501 aa  159  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  30.43 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  29.03 
 
 		 519 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  28.97 
 
 		 506 aa  157  3e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  31.42 
 
 		 512 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>