192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3136 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3136  NmrA family protein  100 
 
 		 337 aa  668    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3907  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  69.72 
 
 		 330 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2842  hypothetical protein  69.85 
 
 		 315 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3070  hypothetical protein  67.89 
 
 		 344 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3798  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.28 
 
 		 344 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387174  normal  0.267254 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  52.99 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  55.49 
 
 		 343 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  53.03 
 
 		 340 aa  372  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  53.27 
 
 		 341 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1059  hypothetical protein  52.74 
 
 		 332 aa  349  3e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000180564  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  52.42 
 
 		 346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  52.28 
 
 		 342 aa  316  4e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  48.8 
 
 		 381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30690  predicted protein  41.82 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0211111  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  31.56 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  30.6 
 
 		 321 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.7 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  31.22 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  28.44 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  28.27 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30 
 
 		 291 aa  85.9  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  27.47 
 
 		 294 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  30.18 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  27.92 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  29.03 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  27.45 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1407  NmrA family protein  29.02 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226857 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.34 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.13 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  29.5 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  27.41 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.45 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.96 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.11 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.15 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.77 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.91 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  26.57 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.46 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  25.95 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  26.92 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.88 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  30.89 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.84 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  34.38 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  27.31 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  27.31 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.24 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  25.19 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  27.48 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  32.02 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  29.15 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  24.24 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  24.22 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  33.76 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.527248  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.5 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  30.14 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  25.11 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  28.77 
 
 		 254 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.45 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  25.77 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  28.4 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  28.75 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  33.73 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  26.01 
 
 		 250 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 		 440 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  31.29 
 
 		 221 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 342 aa  53.5  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 		 440 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.05 
 
 		 227 aa  53.5  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4817  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 		 440 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  31.17 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  26.12 
 
 		 283 aa  53.1  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 		 251 aa  53.1  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  27.78 
 
 		 254 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  27.86 
 
 		 290 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 		 302 aa  52.8  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  29.85 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  28.31 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000218299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>