More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3132 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3132  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 308 aa  593  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509823 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  41.19 
 
 		 313 aa  179  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  41.56 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  40.98 
 
 		 306 aa  165  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  42.57 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  39.35 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  39.35 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  39.35 
 
 		 302 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  41.03 
 
 		 302 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  36.45 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  40.58 
 
 		 299 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  38.71 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  40.66 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  34.82 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  40.07 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  38.31 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  40.72 
 
 		 312 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  38.64 
 
 		 305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  38.49 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  38.46 
 
 		 308 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  35.39 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  41.23 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  38.49 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  38.44 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  38.78 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  41.69 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  32.26 
 
 		 311 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  33.12 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  40.13 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  39.62 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  34.1 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  40.13 
 
 		 309 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  42.63 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  39.3 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  36.89 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  34.74 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  39.3 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  33.97 
 
 		 317 aa  146  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  36.69 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  40.06 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3539  PfkB  40.26 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3612  ribokinase-like domain-containing protein  40.26 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3544  ribokinase-like domain-containing protein  40.26 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  41.56 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  36.3 
 
 		 308 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0279  PfkB domain protein  41.42 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0301345 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  42.45 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  42.07 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  36.36 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  35.18 
 
 		 320 aa  142  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  36.36 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  36.36 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  37.42 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  39.4 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  35.99 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  38.49 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  36.45 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  35.99 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  36.42 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  35.71 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  36.42 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  35.99 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  32.25 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  35.99 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  33.01 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  35.99 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  34.95 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  35.99 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  35.99 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  44.77 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  33.88 
 
 		 303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  32.57 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  36.69 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  40.13 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  38.83 
 
 		 297 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  33.01 
 
 		 310 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  36.16 
 
 		 398 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  38.49 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  34.41 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  38.49 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  35.78 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  37.04 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  42.11 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  37.83 
 
 		 403 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  35.64 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  35.06 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  36.54 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  33.22 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  35.48 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  36.33 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  36.33 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  35.78 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  36.45 
 
 		 295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  36.33 
 
 		 314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  36.33 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  36.33 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  36.33 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  36.25 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  36.33 
 
 		 309 aa  135  9e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  36.33 
 
 		 314 aa  135  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>