119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3109 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3472  peptidase M29 aminopeptidase II  82.72 
 
 
419 aa  679    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.748808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3109  peptidase M29 aminopeptidase II  100 
 
 
420 aa  835    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211466  normal  0.0979106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3670  peptidase M29 aminopeptidase II  81.73 
 
 
419 aa  674    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3780  peptidase M29 aminopeptidase II  82.47 
 
 
419 aa  679    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5302  peptidase M29 aminopeptidase II  90.43 
 
 
418 aa  754    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0490677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3021  aminopeptidase T  73.4 
 
 
418 aa  610  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2148  aminopeptidase PepS  70.3 
 
 
417 aa  565  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1510  peptidase M29 aminopeptidase II  66.83 
 
 
409 aa  562  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.415372  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0763  peptidase M29 aminopeptidase II  68.72 
 
 
417 aa  560  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2184  peptidase M29, aminopeptidase II  68.81 
 
 
423 aa  551  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2586  peptidase M29, aminopeptidase II  66.34 
 
 
418 aa  550  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424521  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7164  peptidase M29, aminopeptidase II  65.35 
 
 
418 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0137  aminopeptidase  66.58 
 
 
416 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4551  peptidase M29 aminopeptidase II  66.34 
 
 
417 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123351  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1971  peptidase M29 aminopeptidase II  67.49 
 
 
410 aa  546  1e-154  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.0591369 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3504  peptidase M29 aminopeptidase II  66.83 
 
 
418 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0622  peptidase M29 aminopeptidase II  65.7 
 
 
415 aa  546  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4287  peptidase M29 aminopeptidase II  66.09 
 
 
417 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.696166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3212  aminopeptidase T  63.55 
 
 
418 aa  542  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3777  peptidase M29, aminopeptidase II  64.11 
 
 
418 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1222  metalloprotease  61.06 
 
 
416 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000553869  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0908  peptidase M29, aminopeptidase II  59.95 
 
 
401 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.941281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1832  peptidase M29 aminopeptidase II  55.58 
 
 
411 aa  464  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0240  peptidase M29, aminopeptidase II  54.17 
 
 
416 aa  416  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2984  peptidase M29 aminopeptidase II  47.9 
 
 
413 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2065  peptidase M29 aminopeptidase II  46.67 
 
 
413 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.610998  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1965  aminopeptidase  42.36 
 
 
411 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2253  aminopeptidase  42.61 
 
 
411 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.06051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0309  peptidase M29 aminopeptidase II  43.21 
 
 
409 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2337  aminopeptidase  42.18 
 
 
409 aa  368  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000192416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0359  aminopeptidase AmpS  42.96 
 
 
409 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0314  aminopeptidase AmpS  42.96 
 
 
409 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0071  peptidase M29, aminopeptidase II  50.37 
 
 
421 aa  365  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0308  peptidase M29 aminopeptidase II  42.96 
 
 
409 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0403  aminopeptidase AmpS  42.96 
 
 
409 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0594317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0297  aminopeptidase; peptidase_M29  42.96 
 
 
409 aa  365  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0361  aminopeptidase AmpS  42.96 
 
 
409 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0301  aminopeptidase; peptidase_M29  42.96 
 
 
409 aa  363  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0376  aminopeptidase AmpS  42.72 
 
 
409 aa  364  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4944  aminopeptidase AmpS  42.72 
 
 
409 aa  364  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0329  aminopeptidase AmpS  42.72 
 
 
409 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2783  peptidase M29 aminopeptidase II  38.48 
 
 
410 aa  355  1e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2902  peptidase M29 aminopeptidase II  41.94 
 
 
409 aa  346  5e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020205  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1887  aminopeptidase 2  40.49 
 
 
409 aa  336  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.302559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3460  aminopeptidase 2  39.26 
 
 
423 aa  325  9e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.044996  hitchhiker  8.080459999999999e-21 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1472  aminopeptidase PepS  39.95 
 
 
413 aa  317  2e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0523  PepS aminopeptidase  39.9 
 
 
409 aa  317  3e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00231455  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0096  aminopeptidase PepS  40 
 
 
413 aa  309  6.999999999999999e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.216815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1933  peptidase M29, aminopeptidase II  38.69 
 
 
415 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1967  peptidase M29 aminopeptidase II  38.69 
 
 
415 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158668  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0078  peptidase M29 aminopeptidase II  41.91 
 
 
413 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1352  peptidase M29 aminopeptidase II  36.03 
 
 
420 aa  292  1e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00264479  normal  0.638771 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0149  peptidase M29, aminopeptidase II  38.42 
 
 
398 aa  289  6e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.868583  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1649  peptidase M29 aminopeptidase II  35.38 
 
 
410 aa  289  7e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1417  aminopeptidase family protein  38.01 
 
 
413 aa  280  3e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0731  peptidase M29 aminopeptidase II  35.82 
 
 
400 aa  277  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5326  peptidase M29 aminopeptidase II  41.23 
 
 
399 aa  262  6.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2181  peptidase M29 aminopeptidase II  39.45 
 
 
404 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0768961  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0070  aminopeptidase II  28.85 
 
 
412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1401  peptidase M29 aminopeptidase II  29.83 
 
 
367 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2712  peptidase M29 aminopeptidase II  31.34 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2644  peptidase M29, aminopeptidase II  29.67 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06890  aminopeptidase protein  26.65 
 
 
368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2642  peptidase M29 aminopeptidase II  27.3 
 
 
366 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1168  peptidase M29, aminopeptidase II  28.82 
 
 
388 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.712634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2758  M29 family peptidase  30.25 
 
 
403 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1489  peptidase M29, aminopeptidase II  30.51 
 
 
370 aa  99.8  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.364607  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3636  peptidase M29 aminopeptidase II  25.56 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2013  peptidase M29 aminopeptidase II  28.21 
 
 
410 aa  97.1  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0975831  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0276  peptidase M29 aminopeptidase II  29.14 
 
 
406 aa  96.7  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0855  metalloprotease  25.82 
 
 
375 aa  96.3  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3114  peptidase M29 aminopeptidase II  28.38 
 
 
367 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1909  peptidase M29, aminopeptidase II  25.28 
 
 
368 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.216085  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0278  peptidase M29 aminopeptidase II  27.48 
 
 
367 aa  94.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1618  peptidase M29 aminopeptidase II  26.58 
 
 
405 aa  94  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0907783  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0868  metalloprotease  25.45 
 
 
375 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0549814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1594  peptidase M29, aminopeptidase II  26.54 
 
 
368 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000189753  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3346  peptidase M29 aminopeptidase II  24.51 
 
 
371 aa  92  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.736707  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2666  peptidase M29 aminopeptidase II  28.5 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0795  peptidase M29, aminopeptidase II  24.58 
 
 
389 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0741  peptidase M29 aminopeptidase II  32.26 
 
 
363 aa  91.3  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0109  peptidase M29 aminopeptidase II  26.94 
 
 
357 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00036007  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_782  aminopeptidase  24.24 
 
 
369 aa  89.7  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1076  peptidase M29 aminopeptidase II  33.47 
 
 
352 aa  89.7  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2115  peptidase M29, aminopeptidase II  27.76 
 
 
367 aa  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.517106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2391  putative aminopeptidase  24.25 
 
 
370 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.982861  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0828  peptidase M29 aminopeptidase II  29.07 
 
 
365 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3214  putative aminopeptidase  25.7 
 
 
371 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2014  peptidase M29 aminopeptidase II  33.17 
 
 
359 aa  87  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0115  peptidase M29 aminopeptidase II  25.13 
 
 
357 aa  86.7  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1842  peptidase M29 aminopeptidase II  30.08 
 
 
366 aa  86.7  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1192  peptidase M29 aminopeptidase II  26.3 
 
 
399 aa  86.3  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.318194 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0443  putative aminopeptidase  23.96 
 
 
371 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2795  peptidase M29 aminopeptidase II  28.39 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0257  peptidase M29 aminopeptidase II  30.23 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0129156 
 
 
-
 
NC_002936  DET0911  aminopeptidase protein  23.42 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0175579  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1777  peptidase M29 aminopeptidase II  25.55 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1311  peptidase M29 aminopeptidase II  31.67 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000144193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4795  putative aminopeptidase  23.96 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4432  aminopeptidase  24.09 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>