203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3097 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  577  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  94.14 
 
 
307 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  57 
 
 
308 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  57.62 
 
 
307 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  55.08 
 
 
308 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  52.65 
 
 
305 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  54.79 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  55.96 
 
 
307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  51.15 
 
 
307 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  53.27 
 
 
343 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  49.67 
 
 
307 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  52.1 
 
 
307 aa  279  5e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  50.16 
 
 
307 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  49.18 
 
 
308 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  51.33 
 
 
310 aa  268  8e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  51.99 
 
 
306 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  50.16 
 
 
307 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  51.99 
 
 
306 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  51.16 
 
 
306 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  53.11 
 
 
306 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  53.14 
 
 
330 aa  256  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  51.82 
 
 
316 aa  256  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  52.32 
 
 
306 aa  255  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  51.82 
 
 
316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  51.82 
 
 
307 aa  244  9e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  46.67 
 
 
315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  52.94 
 
 
308 aa  241  9e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  46.84 
 
 
304 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  51.15 
 
 
307 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  51.64 
 
 
307 aa  225  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  43.42 
 
 
304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  45.64 
 
 
312 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  41.1 
 
 
305 aa  209  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  41 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  40.54 
 
 
303 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  41.08 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  34.62 
 
 
342 aa  122  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  26.86 
 
 
349 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  28.77 
 
 
352 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  29.66 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  29.29 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  28.38 
 
 
361 aa  86.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  29.54 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  26.24 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  30.22 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  26.86 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  30.56 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  27.48 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  26.44 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  25.71 
 
 
415 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  26.96 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  27.81 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  25.37 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  26.38 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  26.97 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  26.89 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  26.1 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  26.56 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  27.17 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  27.46 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  28.1 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  24.6 
 
 
275 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  24.6 
 
 
275 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  28.27 
 
 
349 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  26.11 
 
 
417 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  24.1 
 
 
428 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  25.81 
 
 
443 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  29.95 
 
 
362 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  27.45 
 
 
266 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  26.46 
 
 
266 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  27.37 
 
 
276 aa  62.4  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  27.45 
 
 
266 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  27.34 
 
 
266 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  27.34 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  27.34 
 
 
262 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  27.44 
 
 
309 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  26.95 
 
 
266 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  26.95 
 
 
262 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  25 
 
 
415 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  27.21 
 
 
355 aa  59.3  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  26.95 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  25.45 
 
 
278 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  30.2 
 
 
283 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  27.61 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  26.13 
 
 
354 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  28.52 
 
 
255 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  29.63 
 
 
329 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  26.45 
 
 
261 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  22.02 
 
 
264 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  27.3 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  30.53 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  26.04 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  31.56 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  26.07 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  23.34 
 
 
251 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  26.04 
 
 
286 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  23.34 
 
 
251 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  24.74 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  29.91 
 
 
312 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>