122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2989 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2989  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  100 
 
 		 212 aa  424  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181607  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2349  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  87.79 
 
 		 213 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0094  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  80.09 
 
 		 216 aa  345  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6356  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  57.95 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0695  putative cytochrome c oxidase subunit I  55.84 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5828  cytochrome c oxidase subunit III  51.02 
 
 		 200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  50.51 
 
 		 874 aa  184  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5242  cytochrome c oxidase subunit III  50 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.645563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  50.75 
 
 		 877 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1447  cytochrome c oxidase, subunit III  35.23 
 
 		 203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.703222  normal  0.345478 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  29.59 
 
 		 879 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  29.59 
 
 		 879 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0458  putative cytochrome c oxidase subunit I  30.05 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  28.65 
 
 		 879 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  28.12 
 
 		 882 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0081  putative cytochrome c oxidase subunit III  27.04 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379927  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  30.88 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2028  cytochrome c oxidase subunit III  26.2 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000242871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  30.15 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  29.59 
 
 		 962 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  29.59 
 
 		 974 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  29.59 
 
 		 950 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  30.72 
 
 		 294 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  27.94 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  29.94 
 
 		 876 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  27.94 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  27.21 
 
 		 293 aa  52.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  27.21 
 
 		 293 aa  52.4  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  27.94 
 
 		 293 aa  52.4  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  27.94 
 
 		 294 aa  52  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2185  putative cytochrome c oxidase, subunit III  25.67 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0357507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  24.88 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  28.65 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  27.94 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  28.68 
 
 		 293 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  25.42 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0406  cytochrome c oxidase, subunit I  29.5 
 
 		 818 aa  49.3  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 286 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5489  cytochrome c oxidase subunit III  24.6 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  22.6 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  25.64 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  28.89 
 
 		 288 aa  48.5  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  24.43 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  24.62 
 
 		 268 aa  48.5  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  24.43 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  29.32 
 
 		 286 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  25.24 
 
 		 284 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  24.86 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  26.14 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  20.81 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  25.33 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  25.33 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  25.33 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  27.94 
 
 		 284 aa  47.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  26.32 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  27.66 
 
 		 288 aa  46.6  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  27.14 
 
 		 288 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  27.69 
 
 		 286 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  24.29 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  26.32 
 
 		 298 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  27.07 
 
 		 286 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  29.52 
 
 		 283 aa  45.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  27.07 
 
 		 286 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  26.29 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  26.87 
 
 		 291 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  24.27 
 
 		 284 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  24.03 
 
 		 293 aa  45.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  23.75 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  26.95 
 
 		 285 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  24.29 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  25 
 
 		 295 aa  45.4  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  25.32 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  25.34 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3381  cytochrome c oxidase subunit III  28.73 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0677  cytochrome c oxidase subunit III  27.07 
 
 		 285 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.397658  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  22.22 
 
 		 195 aa  45.1  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  23.03 
 
 		 796 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  27.1 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  24.27 
 
 		 285 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  26.14 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  23.08 
 
 		 295 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  26.32 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  24.26 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3957  cytochrome c oxidase subunit III  26.06 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  23.9 
 
 		 295 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  26.32 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  26.32 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  26.32 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  26.32 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  26.32 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  25.32 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  23.12 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  23.08 
 
 		 295 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  24.24 
 
 		 284 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  19.77 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  24.68 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  24.68 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  24.88 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  21.54 
 
 		 295 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>