241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2957 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  100 
 
 		 190 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  92.63 
 
 		 190 aa  351  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  76.84 
 
 		 195 aa  297  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  75.79 
 
 		 192 aa  293  8e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  75.79 
 
 		 192 aa  293  8e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  75.79 
 
 		 192 aa  292  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  51.02 
 
 		 196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  47.37 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  49.05 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  56 
 
 		 235 aa  170  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  55.33 
 
 		 234 aa  170  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  58 
 
 		 238 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  49.26 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  56.08 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  54.67 
 
 		 235 aa  165  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  48.11 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  44.69 
 
 		 195 aa  148  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  44.69 
 
 		 196 aa  147  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  50.67 
 
 		 189 aa  144  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  46.45 
 
 		 196 aa  144  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  51.33 
 
 		 186 aa  144  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  42.47 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  43.55 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  43.55 
 
 		 191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  46.1 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  42.11 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  47.4 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  39.33 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  45.7 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  44.81 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  34.59 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  39.87 
 
 		 153 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  36.67 
 
 		 193 aa  101  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  33.51 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  33.16 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  37.91 
 
 		 177 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 192 aa  91.7  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  43.52 
 
 		 419 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  34 
 
 		 175 aa  90.9  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  36 
 
 		 152 aa  90.1  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  33.99 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  34.44 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 205 aa  86.3  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  40.38 
 
 		 439 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  39.64 
 
 		 455 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  39.64 
 
 		 455 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  34.21 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  32.45 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  41.76 
 
 		 427 aa  79.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  32.03 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  36.84 
 
 		 264 aa  72  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  33.9 
 
 		 253 aa  72  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  36.84 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  31.61 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  34.59 
 
 		 422 aa  68.6  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  37.5 
 
 		 426 aa  68.2  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  30.67 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  33.8 
 
 		 270 aa  67  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  37.61 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  33.06 
 
 		 437 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  37.04 
 
 		 452 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  31.63 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  36.97 
 
 		 415 aa  65.1  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  36.97 
 
 		 415 aa  65.1  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  32.12 
 
 		 277 aa  65.1  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  35.45 
 
 		 459 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  29.94 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  30.66 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  34.96 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  31.21 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  28.79 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  29.93 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  39.47 
 
 		 816 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  32.26 
 
 		 478 aa  62.8  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  30.66 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 415 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  28.22 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 344 aa  62  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  29.72 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  30.14 
 
 		 351 aa  61.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  35.87 
 
 		 436 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  28.91 
 
 		 268 aa  61.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  33.59 
 
 		 264 aa  61.2  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  30.12 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.14 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  37.14 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  27.75 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  28.05 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  36.36 
 
 		 461 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.59 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  32.37 
 
 		 410 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  34.38 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  30.99 
 
 		 377 aa  58.2  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  42.11 
 
 		 492 aa  58.2  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  27.65 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  33.91 
 
 		 365 aa  57.8  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  31.75 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>