More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2680 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2728  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.53 
 
 		 593 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1750  asparagine synthetase  56.88 
 
 		 595 aa  668    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0957205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1300  asparagine synthase amidotransferase  57.72 
 
 		 595 aa  681    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3398  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  64.59 
 
 		 594 aa  763    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108074  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1633  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  57.02 
 
 		 590 aa  686    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  64.69 
 
 		 600 aa  800    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471232  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0860  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  61.89 
 
 		 594 aa  730    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0424562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3531  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  61.85 
 
 		 596 aa  742    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0213452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3642  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  63.45 
 
 		 591 aa  780    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2541  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.53 
 
 		 621 aa  656    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800468  normal  0.489677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0917  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  61.38 
 
 		 594 aa  733    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5353  asparagine synthase family amidotransferase  70.17 
 
 		 589 aa  854    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3747  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  57.19 
 
 		 590 aa  684    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2955  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.98 
 
 		 589 aa  686    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0385583 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0060  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  56.51 
 
 		 588 aa  649    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5099  asparagine synthase family amidotransferase  58.68 
 
 		 594 aa  712    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4066  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  64.93 
 
 		 601 aa  775    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2293  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  61.38 
 
 		 593 aa  723    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00195658  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4100  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  57.36 
 
 		 590 aa  701    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0114  asparagine synthase family amidotransferase  61.66 
 
 		 592 aa  775    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34960  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.31 
 
 		 589 aa  692    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2461  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.23 
 
 		 593 aa  683    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828988  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1342  asparagine synthase amidotransferase  57.21 
 
 		 595 aa  674    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371916  normal  0.923546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3964  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.55 
 
 		 595 aa  676    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414023  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5018  asparagine synthase family amidotransferase  64.08 
 
 		 593 aa  768    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197798  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2680  asparagine synthase amidotransferase  100 
 
 		 590 aa  1186    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0122276  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0142  asparagine synthase family amidotransferase  90 
 
 		 590 aa  1060    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0588532  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1989  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  63.28 
 
 		 591 aa  743    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3188  asparagine synthase amidotransferase  69.66 
 
 		 589 aa  852    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5410  asparagine synthase family amidotransferase  70.51 
 
 		 589 aa  855    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2910  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  61.21 
 
 		 594 aa  719    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3652  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  58.25 
 
 		 595 aa  696    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  65.27 
 
 		 601 aa  790    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3771  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  53.91 
 
 		 598 aa  646    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.452374  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2055  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  65.27 
 
 		 601 aa  790    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.559869  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  65.14 
 
 		 591 aa  801    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7206  putative asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  64.32 
 
 		 569 aa  762    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3766  asparagine synthase family amidotransferase  61.38 
 
 		 599 aa  725    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1668  asparagine synthase  58.81 
 
 		 589 aa  676    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19370  putative asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  58.98 
 
 		 589 aa  673    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.826487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0216  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.96 
 
 		 598 aa  711    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4868  asparagine synthase amidotransferase  70.34 
 
 		 589 aa  855    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2276  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  64.93 
 
 		 601 aa  780    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315443  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0816  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  61.36 
 
 		 590 aa  754    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2101  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  65.27 
 
 		 601 aa  790    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994358  normal  0.105785 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.45 
 
 		 610 aa  634  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0595  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  52.83 
 
 		 602 aa  627  1e-178  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.957745  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.87 
 
 		 590 aa  622  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1756  asparagine synthase family amidotransferase  54.55 
 
 		 594 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0742  asparagine synthase family amidotransferase  53.52 
 
 		 592 aa  610  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.34 
 
 		 628 aa  326  8.000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.24 
 
 		 646 aa  325  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2408  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.89 
 
 		 635 aa  325  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.8 
 
 		 643 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.47 
 
 		 629 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.18 
 
 		 632 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0138  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.44 
 
 		 631 aa  319  7.999999999999999e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0809158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.82 
 
 		 619 aa  317  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.38 
 
 		 638 aa  316  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0669  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.16 
 
 		 641 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.63 
 
 		 629 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  35.42 
 
 		 643 aa  313  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2327  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.52 
 
 		 629 aa  311  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.752356  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.85 
 
 		 639 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.54 
 
 		 634 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3874  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.42 
 
 		 632 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.55 
 
 		 633 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.49 
 
 		 625 aa  307  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  31.57 
 
 		 632 aa  306  5.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5624  putative asparagine synthetase  35.5 
 
 		 656 aa  306  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.622425  normal  0.579265 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3751  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.34 
 
 		 655 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  31.41 
 
 		 632 aa  306  9.000000000000001e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.06 
 
 		 610 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.91 
 
 		 637 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2519  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.81 
 
 		 647 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.828783  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4005  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.24 
 
 		 622 aa  304  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.33 
 
 		 629 aa  303  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0905  asparagine synthetase family protein  33.28 
 
 		 637 aa  302  1e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.7 
 
 		 632 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288023  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3272  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  35.97 
 
 		 642 aa  301  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1110  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.81 
 
 		 637 aa  300  4e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1919  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.12 
 
 		 631 aa  300  4e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0665  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.34 
 
 		 623 aa  300  7e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5441  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.51 
 
 		 656 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277238  normal  0.0334078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.75 
 
 		 625 aa  298  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2339  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.47 
 
 		 639 aa  296  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.795917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0858  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.2 
 
 		 655 aa  295  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.88 
 
 		 592 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.8 
 
 		 634 aa  295  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0058  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  30.67 
 
 		 629 aa  295  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0712  putative asparagine synthetase  33.49 
 
 		 626 aa  295  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0596  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.96 
 
 		 630 aa  295  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.28 
 
 		 627 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1053  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.25 
 
 		 649 aa  293  4e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000122454  hitchhiker  0.00273706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.39 
 
 		 633 aa  293  7e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641496  normal  0.029694 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4592  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.06 
 
 		 645 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.65001  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3523  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.6 
 
 		 656 aa  290  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.848758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4843  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.6 
 
 		 656 aa  290  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0921814  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  30.97 
 
 		 633 aa  287  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  30.82 
 
 		 633 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>