253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2608 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 141 aa  280  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  77.86 
 
 		 145 aa  225  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  47.86 
 
 		 140 aa  110  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  40.5 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  40.5 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  41.07 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  37.6 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 		 151 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  39.64 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  39.64 
 
 		 154 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  42.02 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  36.28 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 		 136 aa  60.1  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  37.37 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  27.27 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.93 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  24.56 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  28.93 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00696  predicted acyl-CoA thioesterase  29.73 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000730216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.73 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0765  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.73 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.73 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0658  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.73 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013537  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.73 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.73 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2919  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.73 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000323269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  29.73 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  28.46 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  30.77 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0840  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.73 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  0.646292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  26.92 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0807  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.73 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000852325  normal  0.479233 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0902  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.73 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000167631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0871  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.73 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0203461  normal  0.184267 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 283 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0780  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.73 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000472439  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  26.61 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  28.89 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  32.05 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  24.17 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  25.66 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  27.2 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  30.5 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.2 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  27.97 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  29.77 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1234  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  28.83 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.128192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  27.34 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  25.44 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>