More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2520 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3364  integrase catalytic region  99.69 
 
 		 320 aa  649    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2520  integrase catalytic region  100 
 
 		 320 aa  650    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5595  integrase catalytic region  99.69 
 
 		 320 aa  649    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0520  putative transposase  55.66 
 
 		 327 aa  361  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.693676  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0341  putative transposase  55.66 
 
 		 327 aa  361  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5102  integrase catalytic subunit  58.6 
 
 		 339 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4857  integrase catalytic subunit  58.6 
 
 		 338 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3309  integrase catalytic subunit  58.6 
 
 		 338 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5758  integrase catalytic subunit  58.6 
 
 		 338 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0647167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1950  Integrase catalytic region  48.25 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0529  Integrase catalytic region  47.94 
 
 		 325 aa  302  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.247566  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0538  Integrase catalytic region  47.94 
 
 		 325 aa  301  9e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.189416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00368  Transposase  64.05 
 
 		 165 aa  215  7e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1779  Integrase catalytic region  32.89 
 
 		 378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1159  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 358 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.565735  decreased coverage  0.00186464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1853  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 385 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0721  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 360 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208316  decreased coverage  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1352  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1690  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 358 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2064  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 365 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3167  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179309  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 374 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0455  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 371 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1394  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.295612  normal  0.0489416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0711  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 359 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000332452  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2429  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 366 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0896  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 359 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.366884  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1541  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 356 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000437148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3500  hypothetical protein  32.32 
 
 		 364 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000943241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3517  hypothetical protein  32.32 
 
 		 362 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1366  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 361 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000904408  decreased coverage  0.0000712993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0876  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 367 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1990  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 360 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0292285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 390 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2198  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 364 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2719  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 356 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00913617  normal  0.77965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2305  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 386 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.96472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1702  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 364 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.431472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3080  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 371 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3104  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 356 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3325  hypothetical protein  32.32 
 
 		 361 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3369  TROVE domain protein  32.32 
 
 		 359 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3181  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 362 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.299267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0006  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 385 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000397696  normal  0.219937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 411 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2691  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 390 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2762  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 381 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 379 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1071  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 369 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000428907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3016  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 356 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1978  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 360 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  0.284491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2964  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 356 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2485  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 364 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3091  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 358 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1497  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 355 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  hitchhiker  0.000449962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2714  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 362 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  0.786621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 390 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0891  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 379 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233948  normal  0.0447709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2491  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 378 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0709755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1152  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 378 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1564  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 378 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1238  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 378 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0115541  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2732  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 378 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2677  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 371 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000537558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0729  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 378 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00154402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0375  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0088  Integrase catalytic region  31.99 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2869  Integrase catalytic region  32.21 
 
 		 359 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.513593  normal  0.876471 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  30.48 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  29.07 
 
 		 316 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  29.07 
 
 		 316 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  32.48 
 
 		 330 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  30.14 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  30.14 
 
 		 316 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  32.59 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  32.8 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  32.8 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  32.8 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1806  Integrase catalytic region  34.26 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  30.5 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3514  hypothetical protein  34.26 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0359697 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0527  Integrase catalytic region  33.74 
 
 		 349 aa  99.8  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  29.18 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  29.18 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  29.18 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  29.18 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  29.18 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1393  Integrase catalytic region  28.57 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000348935  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  29.39 
 
 		 597 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0044  Integrase catalytic region  28.48 
 
 		 375 aa  92.4  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337574  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  32.86 
 
 		 338 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  30.21 
 
 		 343 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  30.21 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  29.64 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  29.53 
 
 		 607 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  27.52 
 
 		 481 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  28.01 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>