More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2512 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2512  type I secretion system ATPase  100 
 
 
581 aa  1137    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3382  type I secretion system ATPase  87.39 
 
 
579 aa  996    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7141  HlyB family ABC transporter  59.85 
 
 
582 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.470411  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2861  type I secretion system ATPase  61.33 
 
 
577 aa  655    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2739  type I secretion system ATPase  61.58 
 
 
582 aa  639    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2966  type I secretion system ATPase  61.58 
 
 
582 aa  639    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674529  normal  0.737202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3317  type I secretion system ATPase  60.11 
 
 
600 aa  630  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2543  type I secretion system ATPase  58.32 
 
 
614 aa  598  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23418  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3026  Type I secretion system ATPase, PrtD  57.19 
 
 
667 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4390  type I secretion system ATPase  58.73 
 
 
582 aa  596  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.500904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2541  type I secretion system ATPase  59.75 
 
 
598 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0802  Type I secretion system ATPase, PrtD  54.63 
 
 
593 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3226  type I secretion system ATPase  56.05 
 
 
588 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2978  type I secretion system ATPase  57.01 
 
 
589 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1563  type I secretion system ATPase  53.03 
 
 
603 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4336  putative toxin/protease secretion system  51.41 
 
 
583 aa  541  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6292  type I secretion system ATPase  51.82 
 
 
574 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3354  type I secretion system ATPase  47.78 
 
 
578 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74579  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1561  Type I secretion system ATPase, PrtD  47.29 
 
 
583 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323729  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2560  type I secretion system ATPase  47.78 
 
 
578 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3155  type I secretion system ATPase  47.78 
 
 
578 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0792  type I secretion system ATPase  49.07 
 
 
592 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1707  Type I secretion system ATPase, PrtD  44.03 
 
 
596 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1596  type I secretion system ATPase  48.36 
 
 
588 aa  467  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.276203  normal  0.125682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16240  Type I secretion system ATPase  45.45 
 
 
580 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0933  Type I secretion system ATPase, PrtD  46.14 
 
 
584 aa  465  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0820439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3161  Type I secretion system ATPase, PrtD  47.28 
 
 
598 aa  465  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1980  type I secretion system ATPase  48.79 
 
 
588 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15427  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1663  type I secretion system ATPase  48.79 
 
 
588 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1818  Type I secretion system ATPase, PrtD  45.42 
 
 
591 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00373836  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2551  type I secretion system ATPase  47.22 
 
 
578 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961125  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0244  Type I secretion system ATPase, PrtD  44.61 
 
 
592 aa  455  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  44.5 
 
 
570 aa  458  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0892  protein toxin ABC transporter ATPase and inner membrane subunit  47.41 
 
 
578 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287416  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0720  type I secretion system ATPase  45.05 
 
 
572 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3330  ABC transporter, ATP-binding protein  48.27 
 
 
599 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.355213  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0039  Type I secretion system ATPase, PrtD  43.92 
 
 
585 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0115  type I secretion system ATPase  46.3 
 
 
578 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.869815  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2680  Type I secretion system ATPase, PrtD  45.52 
 
 
595 aa  445  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1510  type I secretion system ATPase  46.49 
 
 
643 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8002  type I secretion system ATPase  46.43 
 
 
588 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1114  rhiziobicin secretion  44.26 
 
 
598 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0139  type I secretion system ATPase  43.74 
 
 
579 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.720717  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2036  type I secretion system ATPase  43.49 
 
 
580 aa  439  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0619827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1405  type I secretion system ATPase  42.57 
 
 
603 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.466667  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1555  type I secretion system ATPase  46.25 
 
 
575 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.649141  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5907  type I secretion system ATPase  45.03 
 
 
587 aa  432  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742047  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4146  alkaline protease secretion protein AprD  46.51 
 
 
593 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.591571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48115  alkaline protease secretion protein AprD  46.51 
 
 
593 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.969364  hitchhiker  0.00672446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1321  type I secretion system ATPase  44.27 
 
 
587 aa  430  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0459  hypothetical protein  41.3 
 
 
583 aa  426  1e-118  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00151029  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1280  Type I secretion system ATPase, PrtD  46.95 
 
 
573 aa  423  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2907  type I secretion system ATPase  45.1 
 
 
575 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0433  Type I secretion system ATPase, PrtD  44.57 
 
 
574 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211617  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4928  Type I secretion system ATPase, PrtD  47.3 
 
 
585 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2479  Type I secretion system ATPase, PrtD  45.77 
 
 
587 aa  420  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0339809 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0631  Type I secretion system ATPase, PrtD  39.67 
 
 
592 aa  418  9.999999999999999e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1161  type I secretion system ATPase  44.77 
 
 
587 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.873156 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0383  type I secretion system ATPase  38.93 
 
 
590 aa  415  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1274  type I secretion system ATPase  45.47 
 
 
588 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0270  type I secretion system ATPase  45.95 
 
 
587 aa  415  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0770  type I secretion system ATPase  38.35 
 
 
581 aa  410  1e-113  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4007  type I secretion system ATPase  38.92 
 
 
573 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0583  type I secretion system ATPase  42.37 
 
 
574 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.020719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0618  type I secretion system ATPase  44.9 
 
 
580 aa  405  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3892  ABC transporter  40.46 
 
 
602 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.881504 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4084  type I secretion system ATPase  40.5 
 
 
602 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0132  type I secretion ATP-binding protein  40.32 
 
 
602 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2206  type I secretion system ATPase  42.42 
 
 
582 aa  397  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1409  type I secretion system ATPase  41.19 
 
 
619 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02274  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.83 
 
 
560 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4814  type I secretion system ATPase  40.07 
 
 
591 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3885  putative toxin/protease secretion system  42.04 
 
 
573 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0962  type I secretion system ATPase, PrtD  41.08 
 
 
668 aa  391  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  39.78 
 
 
570 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3437  type I secretion system ATPase  38.97 
 
 
591 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.732646  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0042  type I secretion system ATPase  38.35 
 
 
577 aa  391  1e-107  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.195884  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2948  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.75 
 
 
671 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2107  type I secretion system ATPase  44.82 
 
 
575 aa  388  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1644  type I secretion system ATPase  40.81 
 
 
589 aa  385  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57007  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3586  type I secretion system ATPase  42.08 
 
 
598 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1723  transport protein HasD  44.74 
 
 
595 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05156  heme acquisition ABC transporter HasD  38.95 
 
 
576 aa  378  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20030  transport protein HasD  45.28 
 
 
596 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.863087  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4336  type I secretion system ATPase  39.93 
 
 
663 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270132  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001278  ABC-type protease/lipase transport system ATPase and permease component  38.3 
 
 
535 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1748  type I secretion system ATPase  39.61 
 
 
571 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.492562  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0378  type I secretion system ATPase  41.87 
 
 
573 aa  369  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0307649  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4713  type I secretion system ATPase  39.96 
 
 
589 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0148717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1761  type I secretion system ATPase  38.19 
 
 
573 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2599  type I secretion system ATPase  40.37 
 
 
742 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1749  type I secretion system ATPase  41.13 
 
 
561 aa  363  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0582  type I secretion system ATPase  41.98 
 
 
581 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430347  normal  0.0200066 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0679  Type I secretion system ATPase, PrtD  39.58 
 
 
572 aa  360  5e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0237782 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0063  putative type I secretion system, ATP-binding protein  37.64 
 
 
566 aa  357  5e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3996  type I secretion system ATPase  39.02 
 
 
782 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0680  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.43 
 
 
563 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.738771  normal  0.0936545 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  38.13 
 
 
569 aa  353  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1639  Type I secretion system ATPase, PrtD  39.21 
 
 
582 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4325  type I secretion system ATPase  38.98 
 
 
764 aa  347  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782007  normal  0.0375955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>