261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2455 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2159  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  84.12 
 
 
441 aa  697    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
447 aa  856    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0970  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  77.29 
 
 
441 aa  615  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  77.06 
 
 
441 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1040  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  76.83 
 
 
441 aa  601  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0318758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3124  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  76.57 
 
 
438 aa  585  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.53 
 
 
441 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3259  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.6 
 
 
445 aa  477  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.445117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0333  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.01 
 
 
444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3154  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.6 
 
 
446 aa  448  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2373  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.88 
 
 
453 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3518  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.75 
 
 
422 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.19647 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3185  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.66 
 
 
441 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.551966  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3922  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.12 
 
 
441 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301435  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2922  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.18 
 
 
438 aa  433  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.748886  normal  0.0205845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3185  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.09 
 
 
453 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2219  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.24 
 
 
438 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.867959  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1881  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.68 
 
 
441 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2313  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.07 
 
 
453 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0857022  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2541  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.37 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.8 
 
 
441 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0766234 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.62 
 
 
431 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198297  normal  0.0303559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3359  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.1 
 
 
460 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1296  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.63 
 
 
436 aa  365  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1259  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.4 
 
 
436 aa  364  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.913176  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1889  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.29 
 
 
436 aa  361  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.659609  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2123  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.15 
 
 
435 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226797  hitchhiker  0.00769752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.41 
 
 
436 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0244195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1745  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.89 
 
 
429 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.138174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2623  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.69 
 
 
436 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0367802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.01 
 
 
464 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0224312  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1715  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.2 
 
 
450 aa  298  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4184  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.99 
 
 
460 aa  288  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1262  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.89 
 
 
464 aa  282  9e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3894  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.59 
 
 
460 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0538501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2329  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.63 
 
 
454 aa  280  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1559  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.8 
 
 
454 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0926  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.73 
 
 
482 aa  277  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000234112 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2890  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.49 
 
 
463 aa  275  9e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.59 
 
 
488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.61 
 
 
460 aa  272  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.7 
 
 
464 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0574  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.97 
 
 
467 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0470  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.18 
 
 
462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.59 
 
 
441 aa  269  5.9999999999999995e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.328334  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2607  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.42 
 
 
454 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0183  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.08 
 
 
458 aa  265  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.689135  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.81 
 
 
454 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111628  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2056  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.81 
 
 
455 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2119  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.81 
 
 
455 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0264172 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0243  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.87 
 
 
463 aa  263  6e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1850  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.98 
 
 
454 aa  263  6e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0262  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.54 
 
 
489 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.64 
 
 
463 aa  261  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.27 
 
 
460 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0635  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.5 
 
 
467 aa  259  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873806  normal  0.509374 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_135  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.19 
 
 
463 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09381  putative cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.04 
 
 
475 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.101452 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1001  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.35 
 
 
467 aa  257  3e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.62 
 
 
459 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3750  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.18 
 
 
437 aa  256  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1956  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.3 
 
 
465 aa  256  4e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2211  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.67 
 
 
459 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2257  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.67 
 
 
459 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.356331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2157  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.67 
 
 
459 aa  256  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.02 
 
 
480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2254  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.02 
 
 
538 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1007  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.12 
 
 
442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2367  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.95 
 
 
444 aa  253  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0277  glutamine amidotransferase  42.17 
 
 
435 aa  252  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1187  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  40.4 
 
 
439 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1500  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.16 
 
 
507 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.35762e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2370  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.44 
 
 
459 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4034  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.81 
 
 
427 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0431  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.77 
 
 
474 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0036  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.81 
 
 
460 aa  250  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.77 
 
 
474 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000112468  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase CbiA  43.62 
 
 
457 aa  249  5e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.414294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2715  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.41 
 
 
465 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000497962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.95 
 
 
458 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2297  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.86 
 
 
557 aa  246  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368045  normal  0.0207364 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0327  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.39 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.580612 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1651  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.01 
 
 
436 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961579  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2136  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.31 
 
 
476 aa  244  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.343335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3350  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.31 
 
 
461 aa  242  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91386  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2158  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  40.25 
 
 
439 aa  242  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5859  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.61 
 
 
465 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1380  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.62 
 
 
452 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4466  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.71 
 
 
430 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.360132  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1100  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.31 
 
 
466 aa  239  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.52 
 
 
465 aa  239  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.81 
 
 
502 aa  239  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3680  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.68 
 
 
431 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.42 
 
 
475 aa  239  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.167382 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43 
 
 
443 aa  239  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1740  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40 
 
 
468 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.005379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2785  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing) / cobyrinate a,c-diamide synthase  41.26 
 
 
452 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0078  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.67 
 
 
469 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826564 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.22 
 
 
462 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.49 
 
 
454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.605454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>