More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2425 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  41.78 
 
 		 324 aa  189  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.58 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.99 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3272  hypothetical protein  32.13 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  26.75 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  28.72 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.93 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  26.67 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.53 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  29.97 
 
 		 341 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  25.17 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  26 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.95 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.86 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  27.57 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  25.83 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  25.86 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  30 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.71 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  28.9 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.47 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  24.83 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  31.47 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.52 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  23.47 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  23.47 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.57 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  27.08 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.83 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  26.16 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.1 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  31.64 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  31.38 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  26.09 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  29.45 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.96 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.96 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  26.3 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.47 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  23.47 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  31.74 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  27.93 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  27.68 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.83 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.06 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  22.74 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.06 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  31.45 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  28.62 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  27.57 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  22.38 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  30.3 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12940  membrane protein  25 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000993304  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  27.18 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  27.18 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  22.74 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.67 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  23.18 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.96 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  23.3 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  30.56 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  30.56 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  29.82 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  29.41 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  27.76 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.86 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.83 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.74 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.5 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  27.18 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  27.46 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  30.2 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  24.92 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  30.89 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  24.92 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  23.45 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.93 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  30.96 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  25.26 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  28.83 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  23.13 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.82 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  26.23 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>