20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2312 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2312  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  319  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571534  decreased coverage  0.00751047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3501  hypothetical protein  32.52 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4030  hypothetical protein  36.42 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317302 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3295  hypothetical protein  35.11 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1354  hypothetical protein  36.15 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000200995  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0051  hypothetical protein  33.54 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0978625  normal  0.136632 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1610  nucleic acid binding protein  28.3 
 
 
164 aa  60.8  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1011  hypothetical protein  28.03 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2614  hypothetical protein  28 
 
 
154 aa  59.3  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.345507  normal 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4640  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2350  hypothetical protein  38.4 
 
 
164 aa  53.9  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1370  hypothetical protein  33.12 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.402677 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2824  nucleic acid-binding protein  27.39 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.301151  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0648  hypothetical protein  33.58 
 
 
162 aa  50.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0629  hypothetical protein  36.09 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216798 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0319  hypothetical protein  26.95 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296271  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0162  hypothetical protein  32.62 
 
 
160 aa  48.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4045  hypothetical protein  27.74 
 
 
162 aa  47.4  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.927095 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0102  nucleic acid binding protein  27.04 
 
 
159 aa  44.7  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4273  hypothetical protein  28.39 
 
 
161 aa  44.3  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.243537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>