65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2295 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  391  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  85.99 
 
 
207 aa  347  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  65.38 
 
 
208 aa  248  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  66.01 
 
 
219 aa  242  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  66.01 
 
 
219 aa  242  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  63.24 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  40.91 
 
 
208 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  40 
 
 
186 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  47.16 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  42.62 
 
 
192 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  35.78 
 
 
203 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  35.35 
 
 
203 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  34.8 
 
 
203 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  37.16 
 
 
185 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  36.56 
 
 
190 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  38.6 
 
 
182 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  36.72 
 
 
186 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  38.2 
 
 
186 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  40.35 
 
 
193 aa  99.8  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  37.5 
 
 
215 aa  97.8  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  40.88 
 
 
191 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  40 
 
 
186 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  38.42 
 
 
190 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  36.02 
 
 
186 aa  91.3  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  40.22 
 
 
283 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  39.36 
 
 
191 aa  87.8  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  35.16 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  34.88 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  35.05 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  35.64 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7759  hypothetical protein  38.06 
 
 
171 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00223773  normal  0.120642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  32.96 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  32.02 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  32.81 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  32.98 
 
 
254 aa  68.6  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  31.43 
 
 
183 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  30.96 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  32.77 
 
 
417 aa  63.2  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  29.82 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3886  hypothetical protein  34.01 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.652083 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0343  hypothetical protein  28.1 
 
 
214 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0679  hypothetical protein  36.51 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398543  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  28.42 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  28.74 
 
 
184 aa  52  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  29.55 
 
 
186 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  28.57 
 
 
177 aa  49.3  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  27.62 
 
 
177 aa  48.9  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0749  hypothetical protein  30.47 
 
 
182 aa  48.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  31.67 
 
 
175 aa  48.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8191  protein of unknown function DUF308 membrane  31.35 
 
 
211 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  31.51 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  28.32 
 
 
190 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  27.5 
 
 
193 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  30.41 
 
 
255 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  26.28 
 
 
189 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2336  hypothetical protein  30.84 
 
 
164 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1165  hypothetical protein  29.55 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.912906  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  26.88 
 
 
193 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  26.88 
 
 
193 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  30.57 
 
 
187 aa  42.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2048  hypothetical protein  30.84 
 
 
164 aa  42  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0440  hypothetical protein  23.17 
 
 
180 aa  41.6  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0507632  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  32.31 
 
 
192 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  37.33 
 
 
196 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  31.41 
 
 
187 aa  41.6  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>