179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2243 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 377 aa  741    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  86.74 
 
 		 377 aa  627  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.68 
 
 		 375 aa  309  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.14 
 
 		 375 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.41 
 
 		 375 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.36 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.01 
 
 		 388 aa  295  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.81 
 
 		 374 aa  293  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.99 
 
 		 374 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.44 
 
 		 374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.39 
 
 		 389 aa  279  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.74 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  36.93 
 
 		 410 aa  239  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  40.05 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  37.97 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  34.81 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  34.3 
 
 		 379 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  33.77 
 
 		 379 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  36.24 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  33.15 
 
 		 376 aa  182  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  31.58 
 
 		 390 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.65 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  29.74 
 
 		 385 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.51 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  33.12 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  28.61 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  35.75 
 
 		 373 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  28.05 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  31.16 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36370  carboxylate-amine ligase  39.25 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201432  normal  0.850871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3119  carboxylate-amine ligase  39.02 
 
 		 378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  33.61 
 
 		 368 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  34.42 
 
 		 368 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.94 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.97 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.32 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.97 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.41 
 
 		 378 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  29.97 
 
 		 382 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.82 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.96 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  28.16 
 
 		 399 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.12 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  32.14 
 
 		 850 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.8 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  28.15 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  29.25 
 
 		 360 aa  124  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.28 
 
 		 388 aa  123  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.93 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.63 
 
 		 362 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  29.53 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  31.7 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  29.12 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  30.46 
 
 		 865 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  29.89 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  27.3 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  29.03 
 
 		 376 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  29.2 
 
 		 370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.47 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  30.27 
 
 		 861 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.38 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  27.8 
 
 		 380 aa  116  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  26.35 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  28.97 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  28.87 
 
 		 837 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  28.92 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  27.02 
 
 		 383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  28.93 
 
 		 376 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  28.93 
 
 		 376 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  28.93 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  32.83 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  29.93 
 
 		 376 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.63 
 
 		 380 aa  109  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.65 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  24.77 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  24.77 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  24.77 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  24.77 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.92 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  24.77 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  24.77 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.51 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  27.53 
 
 		 374 aa  98.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2917  carboxylate-amine ligase  26.14 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0214  carboxylate-amine ligase  26.14 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  28.73 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3394  carboxylate-amine ligase  26.14 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533429  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1626  carboxylate-amine ligase  26.14 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0001  carboxylate-amine ligase  26.14 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0001  carboxylate-amine ligase  26.14 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  28.73 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2975  carboxylate-amine ligase  26.14 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5194  carboxylate-amine ligase  24.63 
 
 		 375 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0001  carboxylate-amine ligase  26.25 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0069  carboxylate-amine ligase  24.77 
 
 		 371 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  24.82 
 
 		 371 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.96 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.06 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  25.59 
 
 		 371 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.96 
 
 		 381 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>