266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2233 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  85.85 
 
 		 457 aa  647    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  100 
 
 		 434 aa  819    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  70.23 
 
 		 442 aa  550  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  71.2 
 
 		 450 aa  549  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  70 
 
 		 442 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  68.94 
 
 		 458 aa  525  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  34.94 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  35.56 
 
 		 476 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  33.5 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  32.9 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  34.21 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  35.31 
 
 		 414 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  34.98 
 
 		 422 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  36.25 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  34.41 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  33.33 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  34.98 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  35.21 
 
 		 422 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  34.03 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  32.91 
 
 		 450 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 469 aa  136  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  37.99 
 
 		 439 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  33.82 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  24.94 
 
 		 495 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  33.09 
 
 		 422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  30.41 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  25.17 
 
 		 495 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  32.03 
 
 		 504 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  33.95 
 
 		 419 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  36.63 
 
 		 476 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  25.64 
 
 		 436 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  34.26 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  33.99 
 
 		 456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  32.8 
 
 		 427 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  32.7 
 
 		 409 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  33.77 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  28.57 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  31.14 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  32.94 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  32.37 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  31.86 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  29.61 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  30.56 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  34.62 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  31.45 
 
 		 422 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  26.93 
 
 		 470 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  26.34 
 
 		 481 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  26.93 
 
 		 468 aa  94.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  31.18 
 
 		 412 aa  92.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  32.56 
 
 		 423 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  34.19 
 
 		 407 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  33.82 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  28.31 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  29.29 
 
 		 657 aa  84.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  29.01 
 
 		 1199 aa  84  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  27.86 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  27.88 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  32.17 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  31.17 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  37.23 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  26.44 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  26.61 
 
 		 628 aa  77.8  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  24.43 
 
 		 536 aa  71.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  30.93 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  48.45 
 
 		 450 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  61.4 
 
 		 462 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  48.45 
 
 		 450 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  48.57 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  27.41 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  61.82 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  28.48 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  58.18 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  28.21 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  24.55 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  57.81 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  25.49 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  25.61 
 
 		 493 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  60 
 
 		 463 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  28.21 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  28.21 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  27.06 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  32.95 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  27.11 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  25.73 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  53.57 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  51.79 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  46.07 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 		 578 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  27.74 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  33.59 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  50.79 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  48.28 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  43.53 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  27.08 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  29.85 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  27.86 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  22.62 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  53.45 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  27.45 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>