56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2231 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  387  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  90.51 
 
 		 187 aa  291  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2687  hypothetical protein  67.36 
 
 		 187 aa  241  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  75.64 
 
 		 197 aa  234  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  73.72 
 
 		 197 aa  229  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  73.72 
 
 		 197 aa  229  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  63.75 
 
 		 192 aa  203  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  66.01 
 
 		 177 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  55.62 
 
 		 176 aa  181  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  53.33 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  58.67 
 
 		 174 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  53.07 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  58 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  59.06 
 
 		 183 aa  174  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  58 
 
 		 175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  54.86 
 
 		 137 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  48.35 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  48.35 
 
 		 181 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  46.15 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  44.81 
 
 		 190 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  43.52 
 
 		 199 aa  150  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  43.26 
 
 		 179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  38.74 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  44.44 
 
 		 179 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  42.7 
 
 		 183 aa  134  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  41.95 
 
 		 239 aa  127  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  37.89 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  37.77 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  37.93 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  42.11 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1942  hypothetical protein  43.42 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398084  decreased coverage  0.00719314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  42.11 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0914  hypothetical protein  34.02 
 
 		 190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  43.92 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  39.77 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  38.19 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4584  hypothetical protein  39.58 
 
 		 160 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  40 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2170  hypothetical protein  31.75 
 
 		 177 aa  92  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.82966  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2307  hypothetical protein  33.82 
 
 		 173 aa  88.6  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2000  protein of unknown function DUF1058  29.74 
 
 		 367 aa  87.8  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  35.77 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1176  hypothetical protein  24.44 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0614  hypothetical protein  28.08 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  33.7 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  27.15 
 
 		 162 aa  49.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  29.84 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  26.36 
 
 		 149 aa  44.7  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  28.37 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  28.37 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2184  hypothetical protein  20.59 
 
 		 141 aa  42.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2403  hypothetical protein  42.86 
 
 		 156 aa  42.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.482031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  26.88 
 
 		 532 aa  41.6  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4026  peptidase M23B  38.89 
 
 		 539 aa  41.6  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  25.81 
 
 		 532 aa  41.2  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>